252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1549 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  100 
 
 		 160 aa  325  1.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  56.49 
 
 		 231 aa  177  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  48.03 
 
 		 207 aa  122  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.13 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  36.42 
 
 		 225 aa  107  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.53 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  34.9 
 
 		 177 aa  104  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  41.07 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  29.38 
 
 		 238 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  37.6 
 
 		 139 aa  91.3  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  33.55 
 
 		 163 aa  90.1  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  36.52 
 
 		 144 aa  88.2  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.59 
 
 		 153 aa  87.4  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  34.9 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  38.14 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.54 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  38.1 
 
 		 223 aa  86.3  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  35.34 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.94 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  34.09 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.38 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  37.01 
 
 		 133 aa  85.1  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  39.29 
 
 		 142 aa  84.7  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.32 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  37.7 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  38.26 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  36.36 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0427  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000575669  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  37.21 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  35.17 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  38.68 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  39.83 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  31.2 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  30.89 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  30.89 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.71 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  30.08 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  34.07 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.66 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.48 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  31.71 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  36.36 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.4 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.58 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  34.71 
 
 		 221 aa  74.3  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  38.18 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.74 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  34.48 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0156  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.28 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.72 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  31.93 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.35 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  36.17 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  34.96 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1082  iron dependent repressor  33.93 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0224083  hitchhiker  0.00000000150507 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  34.96 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  34.96 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  34.96 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  34.96 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  34.96 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  34.96 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  34.96 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1472  iron dependent repressor  31.25 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.797934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  34.75 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  34.75 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  34.15 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  40 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.37 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1784  iron dependent repressor  29.85 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  34.48 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  34.48 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  29.6 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  38.89 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1404  manganese transport transcriptional regulator  32.64 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  33.05 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  39.42 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  38.61 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0146  iron dependent repressor  28.99 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.9 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1495  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.65 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  31.58 
 
 		 255 aa  63.9  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.06 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.84 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  31.4 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  33.8 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  28.8 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.33 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  30.58 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.9 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.17 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0384  putative PAS/PAC sensor protein  30.97 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  30.88 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  35.64 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  34.86 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1346  histidine kinase  33.04 
 
 		 390 aa  62.4  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129942  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0113  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 209 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  37.96 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>