213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3788 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  62.61 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  62.86 
 
 		 145 aa  140  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  54.26 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  53.19 
 
 		 141 aa  127  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  51.15 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  55.75 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  55.75 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  58.99 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  57.52 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  55.36 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0219  hypothetical protein  58.82 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.45 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  41.22 
 
 		 163 aa  87.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  39.02 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  34.81 
 
 		 139 aa  84.3  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  43.18 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  41.61 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  42.42 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  42.42 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1475  protein of unknown function DUF336  50 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  41.67 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  42.86 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  38.13 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  35.46 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  46.94 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  37.78 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  37.5 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  39.45 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  42.86 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  37.7 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1588  hypothetical protein  38.03 
 
 		 167 aa  72  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  39.71 
 
 		 168 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0124  hypothetical protein  37.59 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  36.64 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  42.34 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  37.69 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  38.46 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  37.12 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  41.07 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  37.31 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  34.62 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  43 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  37.88 
 
 		 133 aa  67  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  36.15 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  42.19 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  36.57 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  36.57 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  40 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  41.67 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  34.56 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  38.05 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  36.84 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  36.09 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  35.83 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  33.86 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  32.84 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  38.05 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  35.65 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  37.96 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  31.06 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  42.61 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  34.35 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  38.39 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  33.82 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  36.61 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  34.81 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  31.51 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  38.18 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  32.03 
 
 		 179 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  33.58 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  37.5 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  40.19 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  36.11 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  38.18 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  34.35 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  39.09 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  35.21 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  35.25 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  36.03 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  37.62 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  37.62 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  37.62 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  34.17 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  32.31 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  36.61 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  30.95 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  36.04 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  34.68 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  34.68 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  34.07 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  34.23 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  36.63 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2239  hypothetical protein  35.34 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  33.64 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  32.54 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>