More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5916 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  100 
 
 
303 aa  594  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0601  rare lipoprotein A  49.77 
 
 
238 aa  168  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0622  rare lipoprotein A  61.59 
 
 
175 aa  159  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.717997  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4056  rare lipoprotein A  66.67 
 
 
108 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.926393  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  53.38 
 
 
213 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  59.55 
 
 
342 aa  125  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
360 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
360 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  58.51 
 
 
324 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  61.36 
 
 
358 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  64.44 
 
 
238 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4680  rare lipoprotein A  53.85 
 
 
199 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  58.59 
 
 
212 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  62.65 
 
 
122 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  43.14 
 
 
200 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  66.27 
 
 
121 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  63.33 
 
 
140 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  41.3 
 
 
262 aa  117  3e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  40 
 
 
211 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  61.29 
 
 
121 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  38.76 
 
 
230 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  63.86 
 
 
122 aa  116  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  64.71 
 
 
121 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  38.28 
 
 
230 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  38.28 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  58.33 
 
 
157 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  43.14 
 
 
200 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  38.28 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  38.28 
 
 
211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  38.28 
 
 
211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  38.28 
 
 
211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  59.57 
 
 
371 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  42.11 
 
 
163 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  60.23 
 
 
153 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  58.43 
 
 
367 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  62.96 
 
 
168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  46.67 
 
 
249 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  41.71 
 
 
199 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  56.82 
 
 
335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  36.59 
 
 
251 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  39.58 
 
 
202 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  63.75 
 
 
199 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  51.55 
 
 
170 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  46.15 
 
 
203 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  62.5 
 
 
94 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  52.68 
 
 
175 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  53.68 
 
 
124 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  59.57 
 
 
124 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  61.54 
 
 
134 aa  106  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  50 
 
 
322 aa  106  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  51.49 
 
 
165 aa  105  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  46.15 
 
 
214 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  48.45 
 
 
186 aa  105  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  45.38 
 
 
203 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  43.38 
 
 
162 aa  105  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  47 
 
 
239 aa  105  9e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  57.78 
 
 
227 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  54.55 
 
 
124 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  53.33 
 
 
198 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  54.17 
 
 
145 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  56.84 
 
 
144 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  53.54 
 
 
155 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  54.55 
 
 
124 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  54.55 
 
 
124 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3465  rare lipoprotein A  40.85 
 
 
250 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  45.38 
 
 
203 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  43.51 
 
 
179 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  32.91 
 
 
471 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2271  rare lipoprotein A  59.21 
 
 
120 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  52.13 
 
 
181 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  41.51 
 
 
331 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  58.51 
 
 
124 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  53.12 
 
 
124 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  52.75 
 
 
238 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  32.84 
 
 
297 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  45.38 
 
 
213 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4083  rare lipoprotein A  59.76 
 
 
144 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  38.85 
 
 
284 aa  103  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  52.22 
 
 
206 aa  103  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  42.28 
 
 
196 aa  102  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  58.7 
 
 
119 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  52.22 
 
 
206 aa  102  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  45.38 
 
 
213 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0749  rare lipoprotein A  51.11 
 
 
330 aa  102  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  35.77 
 
 
266 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  51.11 
 
 
240 aa  102  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  39.04 
 
 
230 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3267  putative lipoprotein  51 
 
 
234 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  35.77 
 
 
275 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  35.77 
 
 
275 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  41.26 
 
 
258 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  40 
 
 
259 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3267  rare lipoprotein A  50 
 
 
247 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  47.11 
 
 
139 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  37.08 
 
 
260 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  52.22 
 
 
409 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0789  rare lipoprotein A  35.93 
 
 
253 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  53.85 
 
 
324 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  62.2 
 
 
116 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  42.76 
 
 
381 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>