More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3192 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  100 
 
 		 413 aa  775    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  40.71 
 
 		 430 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  38.34 
 
 		 420 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  38.02 
 
 		 423 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  38.02 
 
 		 423 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  37.07 
 
 		 439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 424 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  36.92 
 
 		 422 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 459 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 408 aa  162  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 486 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  29.38 
 
 		 434 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 410 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 430 aa  94.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 425 aa  93.6  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  28.57 
 
 		 425 aa  93.2  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 426 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 402 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  26.18 
 
 		 400 aa  86.7  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08934  conserved hypothetical protein  27.49 
 
 		 432 aa  86.3  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279116  normal  0.171423 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  26.52 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  28.61 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  25.79 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  25.79 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  25.79 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  26.77 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  25.53 
 
 		 398 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  25.53 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  26.46 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  27.27 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  26.4 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  26.4 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  26.4 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36120  monocarboxylate permease homologue  24.74 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.590226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  27.17 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  30.22 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  29.31 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0905  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  26.24 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  26.13 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  26.13 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2073  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 430 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  0.521626 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  26.13 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02746  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05170)  25.2 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10624  normal  0.606528 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  26.13 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0904  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08789  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12710)  26.61 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02358  conserved hypothetical protein  25.95 
 
 		 448 aa  76.6  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  24.07 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  24.07 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  24.86 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3053  sugar phosphate permease-like  24.88 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  23.5 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>