More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1664 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1664  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 199 aa  397  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3138  short chain dehydrogenase  64.14 
 
 		 200 aa  260  6.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0927  short chain dehydrogenase  60.8 
 
 		 200 aa  236  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3331  short chain dehydrogenase  63 
 
 		 201 aa  231  6e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4448  short chain dehydrogenase  56.85 
 
 		 201 aa  230  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4284  short chain dehydrogenase  56.35 
 
 		 201 aa  229  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.206363 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0613  short chain dehydrogenase  56.85 
 
 		 201 aa  230  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0886445 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3200  short chain dehydrogenase  61.31 
 
 		 217 aa  229  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4883  short chain dehydrogenase  55.5 
 
 		 202 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50610  short chain dehydrogenase  55.56 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0391945 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5475  short chain dehydrogenase  55 
 
 		 202 aa  224  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4312  short chain dehydrogenase  54.04 
 
 		 199 aa  224  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5387  short chain dehydrogenase  55 
 
 		 202 aa  224  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1238  short chain dehydrogenase  52.53 
 
 		 199 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3526  short chain dehydrogenase  61.05 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0313  short chain dehydrogenase  47.47 
 
 		 199 aa  207  9e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0297  short chain dehydrogenase  47.47 
 
 		 199 aa  207  9e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0657  short chain dehydrogenase  46.19 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.769936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5629  short chain dehydrogenase  47.21 
 
 		 198 aa  188  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2512  short chain dehydrogenase  47.47 
 
 		 199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296656  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2493  short chain dehydrogenase  45.69 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3793  short chain dehydrogenase  43.43 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3670  short chain dehydrogenase  43.94 
 
 		 208 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0789  short chain dehydrogenase  45.96 
 
 		 205 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1726  short chain dehydrogenase  44.67 
 
 		 200 aa  167  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06295  short chain dehydrogenase  37.88 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05280  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 		 200 aa  164  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3613  short chain dehydrogenase  42.93 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1873  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2520  short chain dehydrogenase  39.59 
 
 		 199 aa  148  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0216463  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl362  short chain dehydrogenase  37.81 
 
 		 202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.68833e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1736  short chain dehydrogenase  37.88 
 
 		 201 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.157452 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2619  short chain dehydrogenase  37.37 
 
 		 201 aa  144  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4306  short chain dehydrogenase  39.8 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1778  short chain dehydrogenase  40.98 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6188  short chain dehydrogenase  40.64 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  32.77 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  36.78 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  28.1 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.24 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1057  short chain dehydrogenase; 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  27.33 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.474453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.88 
 
 		 288 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07806  Versicolorin reductase (EC 1.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00791]  29.2 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00450533  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  30.25 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.74 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3870  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.21 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1207  short chain dehydrogenase  27.37 
 
 		 337 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.66 
 
 		 294 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.92 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.872863 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 		 269 aa  53.9  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09158  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01040)  27.81 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.07 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  28.24 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  27.94 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 		 256 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.12 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.65 
 
 		 237 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.85 
 
 		 248 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.15 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6322  putative short-chain dehydrogenase  26.6 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72840  putative short-chain dehydrogenase  26.6 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 		 250 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 		 249 aa  51.6  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3935  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 		 253 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0101675 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 		 270 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4032  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 256 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.24 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.03 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  30.25 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.87 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.73 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2093  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  25.14 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.034658  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2488  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  25.14 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000275641  hitchhiker  0.0000923684 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  28.09 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.82 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>