More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4032 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4032  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
256 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.77 
 
 
256 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.2 
 
 
256 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192127  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
265 aa  135  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.23 
 
 
262 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 
267 aa  122  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7138  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
262 aa  115  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
260 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
254 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.98 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.23 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
262 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
294 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 
284 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.22798  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.196322  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 
234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5228  short chain dehydrogenase  28.12 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.940368  normal  0.168178 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.28 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00435006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
255 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0149136  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1381  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.72 
 
 
248 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.049098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2001  putative short-chain alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
262 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.35 
 
 
261 aa  108  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.199007  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
261 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.27 
 
 
285 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  30.45 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.8 
 
 
246 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.42 
 
 
283 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.43 
 
 
247 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1530  short chain dehydrogenase  27.73 
 
 
263 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 
283 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623157  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 
234 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.312324 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.47 
 
 
247 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.296553  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
263 aa  107  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.544381  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
287 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  28.52 
 
 
286 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
291 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.608035  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27180  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  32.69 
 
 
281 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.46 
 
 
258 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00507501  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 
260 aa  107  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5297  short chain dehydrogenase  31.15 
 
 
317 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460339 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
234 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.906179 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
252 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.47 
 
 
247 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000555171 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.56 
 
 
249 aa  106  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
247 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
282 aa  105  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.28 
 
 
287 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
260 aa  105  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 
254 aa  105  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.59 
 
 
246 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  34.39 
 
 
247 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
253 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1010  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.87 
 
 
253 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
256 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
256 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
234 aa  104  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.63 
 
 
251 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.82 
 
 
287 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.46 
 
 
260 aa  104  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0620  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.27 
 
 
250 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.890979 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03679  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_4G05870)  27.95 
 
 
302 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0128592 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3090  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.86 
 
 
264 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 
246 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.69 
 
 
250 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.69 
 
 
250 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
264 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.53126  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  30.45 
 
 
264 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 
234 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3407  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  26.24 
 
 
264 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
262 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 
247 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.92 
 
 
266 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5249  short chain dehydrogenase  31.18 
 
 
318 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.109132  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.52 
 
 
250 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5029  short chain dehydrogenase  28.52 
 
 
261 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.30549  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
263 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622858  normal  0.939609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4646  short chain dehydrogenase  28.52 
 
 
261 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.24 
 
 
246 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3420  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  26.24 
 
 
264 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11020  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.84 
 
 
253 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4734  short chain dehydrogenase  28.52 
 
 
261 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.332046  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 
255 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
250 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.681142  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.46 
 
 
247 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
256 aa  102  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36870  putative short-chain dehydrogenase  28.12 
 
 
286 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
362 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00359465  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
287 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259282  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2744  short chain dehydrogenase  31.37 
 
 
334 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0520687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.5 
 
 
285 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  29.62 
 
 
257 aa  102  6e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3188  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.86 
 
 
264 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 
258 aa  102  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.8 
 
 
260 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3440  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.86 
 
 
264 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.29 
 
 
246 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>