208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1613 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  300  4.0000000000000003e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  85.71 
 
 		 147 aa  265  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  83.56 
 
 		 147 aa  256  8e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  40.61 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  44.78 
 
 		 162 aa  107  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  50.39 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  42.96 
 
 		 182 aa  103  7e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  42.4 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 		 154 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  42.54 
 
 		 153 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  37.84 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  39.46 
 
 		 160 aa  99.4  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  39.19 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  42.15 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  41.41 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  39.84 
 
 		 150 aa  97.1  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  42.11 
 
 		 173 aa  96.3  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  36.51 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  41.23 
 
 		 167 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  35.15 
 
 		 180 aa  94.7  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  41.96 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  36.51 
 
 		 157 aa  94  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  43.22 
 
 		 160 aa  94  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  38.26 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  34.92 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  48.04 
 
 		 160 aa  92.8  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0423  hypothetical protein  47.06 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.237616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  34.92 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  34.92 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  34.92 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  37.98 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  44.35 
 
 		 164 aa  91.7  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  44 
 
 		 160 aa  91.7  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  41.13 
 
 		 294 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  46.09 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  34.01 
 
 		 167 aa  90.9  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  37.61 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  37.06 
 
 		 164 aa  88.2  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2252  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.89628e-27 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  43.14 
 
 		 162 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  36.05 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  37.31 
 
 		 183 aa  86.7  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  41.96 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  46.39 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  46.32 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  36.76 
 
 		 143 aa  84.3  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  36.76 
 
 		 143 aa  84.3  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  44 
 
 		 160 aa  84  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  35.9 
 
 		 181 aa  84  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  39.82 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  44.68 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  36.61 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0302  hypothetical protein  38.74 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  37.41 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  34.38 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  36.3 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  39.23 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  40.71 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  38.24 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  38.94 
 
 		 244 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  34.01 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  38.94 
 
 		 244 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  39.82 
 
 		 244 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  33.56 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  32.39 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  40.82 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  38.94 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  38.94 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  39.32 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  41.49 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  38.94 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  38.94 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  37.12 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  38.94 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  40.38 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  46.32 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  46.32 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  32.14 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  43.18 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  46.32 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  42.55 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  46.32 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3476  protein of unknown function UPF0066  34.29 
 
 		 283 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1303  protein of unknown function UPF0066  34.07 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  37.59 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  36.44 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  39.1 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  46.32 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  46.32 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3420  hypothetical protein  33.94 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82049  normal  0.0336552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  46.32 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  46.32 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  46.32 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  36.42 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 		 228 aa  77.4  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>