202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1536 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1536  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  330  7.000000000000001e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.646102  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1428  transcriptional regulator, MarR family  81.48 
 
 		 162 aa  279  1e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1381  transcriptional regulator, MarR family  54.97 
 
 		 161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1525  transcriptional regulator, putative  51.55 
 
 		 170 aa  170  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1325  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 169 aa  110  6e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.452176  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1520  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.854006  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1376  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1365  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1172  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0004084  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1361  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1422  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.40162  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0987  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1400  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00128815  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  24.36 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  24.39 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  27 
 
 		 177 aa  50.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1562  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1389  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000012285  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1264  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  28.35 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  24.52 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  23.61 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2040  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.220798  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 146 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 146 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 146 aa  47.4  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  30.85 
 
 		 139 aa  47.4  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 139 aa  47.4  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1976  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19608e-17 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  29.35 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  25.96 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2019  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0472428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1801  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1775  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1758  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1940  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1941  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1806  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  20.71 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  25.51 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  23.19 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3388  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.000000000214754 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  24.58 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  28 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  23.44 
 
 		 141 aa  45.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  24.31 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  23.08 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  26.32 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  26.32 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  26.32 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  26.32 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  26.32 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1649  homoprotocatechuate degradative operon repressor  27.27 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.976372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 148 aa  44.3  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2462  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2366  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  27.27 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.738628  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 146 aa  43.9  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>