18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1562 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1562  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
146 aa  299  8.000000000000001e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0572  MarR family transcriptional regulator  80.56 
 
 
146 aa  251  3e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.280849  hitchhiker  0.000973334 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1742  MarR family transcriptional regulator  76.6 
 
 
146 aa  243  9e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.367615  decreased coverage  0.000262536 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1735  MarR family transcriptional regulator  74.31 
 
 
149 aa  236  8e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.560493 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0135  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
145 aa  90.1  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0370  hypothetical protein  34.23 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1536  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.646102  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1396  hypothetical protein  24.58 
 
 
291 aa  47.4  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1428  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0176  hypothetical protein  27.61 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0137  hypothetical protein  33.03 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.536436  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  34.62 
 
 
146 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  34.62 
 
 
146 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  34.62 
 
 
146 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0324  hypothetical protein  46.51 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
189 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  34.21 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>