20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0324 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0324  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  245  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1614  hypothetical protein  52.73 
 
 
113 aa  124  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.19093 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1565  hypothetical protein  45.61 
 
 
112 aa  122  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1540  hypothetical protein  46.43 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1204  hypothetical protein  43.86 
 
 
122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0300444 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0137  hypothetical protein  45.37 
 
 
122 aa  103  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.536436  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0176  hypothetical protein  42.48 
 
 
116 aa  94.4  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3598  hypothetical protein  40 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0387  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3552  transcription repressor CinR  37.39 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.498012  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0795  hypothetical protein  35.65 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.453184  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1771  hypothetical protein  37.39 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2319  transcription repressor CinR  38.26 
 
 
114 aa  67  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.628193 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0370  hypothetical protein  36.08 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1396  hypothetical protein  31.31 
 
 
291 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0572  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.280849  hitchhiker  0.000973334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1735  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
149 aa  42  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.560493 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1562  MarR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 
259 aa  40  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>