16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1565 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1565  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  226  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1614  hypothetical protein  64.81 
 
 		 113 aa  148  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.19093 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1540  hypothetical protein  62.62 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1204  hypothetical protein  58.93 
 
 		 122 aa  143  8.000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0300444 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0324  hypothetical protein  45.61 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0137  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  100  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.536436  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3598  hypothetical protein  47.62 
 
 		 139 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0176  hypothetical protein  47.22 
 
 		 116 aa  97.1  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0795  hypothetical protein  36.94 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.453184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0387  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2319  transcription repressor CinR  38.18 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.628193 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3552  transcription repressor CinR  37.63 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.498012  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1771  hypothetical protein  36.56 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0370  hypothetical protein  37.76 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1396  hypothetical protein  34.74 
 
 		 291 aa  44.3  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0135  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 145 aa  40.4  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>