26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1735 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1735  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  299  8.000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.560493 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1742  MarR family transcriptional regulator  81.43 
 
 		 146 aa  244  3e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.367615  decreased coverage  0.000262536 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0572  MarR family transcriptional regulator  77.93 
 
 		 146 aa  240  5e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.280849  hitchhiker  0.000973334 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1562  MarR family transcriptional regulator  74.31 
 
 		 146 aa  236  8e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0135  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0370  hypothetical protein  31.48 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1396  hypothetical protein  28.21 
 
 		 291 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1536  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.646102  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0324  hypothetical protein  28.45 
 
 		 120 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 150 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  35.8 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1428  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  35.8 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  35.8 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  35.8 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  35.8 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  35.8 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  35.8 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  35.8 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>