81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3385 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3385  type IV pilin protein, putative  100 
 
 		 172 aa  342  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1711  type 4 prepilin-like protein  37.04 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1736  hypothetical protein  37.04 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5159  type 4 prepilin-like protein  34.44 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.259971  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0372  type 4 prepilin-like protein  35.47 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1601  type 4 pilin  26.75 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2479  pilin-like protein  29.41 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209449  hitchhiker  0.0000256314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5000  hypothetical protein  25 
 
 		 215 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  38.57 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0267  hypothetical protein  37.66 
 
 		 225 aa  50.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  34.18 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  41.18 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  32.23 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  34.57 
 
 		 188 aa  48.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  34.72 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  39.74 
 
 		 214 aa  47.8  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  34.15 
 
 		 182 aa  47.8  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  41.89 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  36.49 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  31.06 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  36.78 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  33.87 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.31 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.31 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.31 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  27.54 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  38.98 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  34.43 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.75 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  28.46 
 
 		 179 aa  44.7  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  35.62 
 
 		 206 aa  44.7  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  34.29 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.64 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  50 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.84 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  25 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  30 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0963  N-terminal methylation  34.29 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31.65 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1878  hypothetical protein  41.51 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  44.68 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  27.27 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  30 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  30 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  30.67 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  34.15 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.58 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  32.93 
 
 		 133 aa  42.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  29.81 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  26.53 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3553  hypothetical protein  26.21 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  42.19 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.11 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  25.93 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  35 
 
 		 136 aa  42  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  35.71 
 
 		 201 aa  42  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1025  hypothetical protein  27.69 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  31.08 
 
 		 191 aa  41.6  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  35.38 
 
 		 169 aa  42  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  26.81 
 
 		 141 aa  42  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  33.78 
 
 		 133 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  28.89 
 
 		 182 aa  41.6  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.79 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.58 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2590  pilin-like protein-like  28.4 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.545428 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  28.16 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  35.96 
 
 		 178 aa  41.2  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  31.43 
 
 		 157 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.33 
 
 		 167 aa  40.8  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  32.88 
 
 		 142 aa  40.8  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  35.48 
 
 		 186 aa  40.8  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30 
 
 		 163 aa  40.8  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  25.66 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  44.44 
 
 		 170 aa  40.8  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  34.78 
 
 		 186 aa  40.8  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  41.67 
 
 		 138 aa  40.8  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.21 
 
 		 165 aa  40.8  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  43.14 
 
 		 141 aa  40.8  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  31.63 
 
 		 138 aa  40.8  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>