More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3097 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3097  site-specific recombinase XerD-like protein  100 
 
 		 205 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5393  integrase family protein  60.91 
 
 		 304 aa  254  8e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  26.99 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  26.34 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  31.41 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.16 
 
 		 324 aa  65.5  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0498  phage integrase family protein  32.32 
 
 		 390 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000218969  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.16 
 
 		 324 aa  64.7  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  32.24 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  27.66 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1434  phage integrase family protein  28.04 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  30.5 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  28.65 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  28.49 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0900  integrase  28.57 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000819417  hitchhiker  0.000000626468 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  27.75 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0872  phage integrase family protein  28.04 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  32.17 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  28.11 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  28.83 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  31.21 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  31.21 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  26.4 
 
 		 301 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  29.19 
 
 		 302 aa  61.6  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.15 
 
 		 297 aa  62  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2705  integrase family protein  27.54 
 
 		 304 aa  61.6  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.800791  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.64 
 
 		 311 aa  61.2  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  26.74 
 
 		 307 aa  61.2  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.75 
 
 		 305 aa  61.2  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  27.55 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  29.46 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  24.42 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  26.74 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0523  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.46 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5891  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0118  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.32 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  28.65 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  29.45 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0914  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.32 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1246  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2504  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.32 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0911  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.32 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  30.3 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2607  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  29.41 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.5 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.74 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0369  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.32 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  31.87 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0669  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.32 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  30.4 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  26.61 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1067  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.4 
 
 		 305 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2834  integrase family protein  31.22 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.061361  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  26.2 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2478  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 		 322 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183983 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  31.58 
 
 		 304 aa  58.2  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  32.61 
 
 		 302 aa  58.2  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  27.46 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0726  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.32 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218987  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  29.23 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.78 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  30.2 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1716  tyrosine recombinase XerD  29.08 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  25 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3096  tyrosine recombinase XerD subunit  31.1 
 
 		 311 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00033868  normal  0.385268 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  27.43 
 
 		 322 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  28.02 
 
 		 305 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4561  hypothetical protein  26.44 
 
 		 311 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0028561  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1948  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 		 318 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  27.98 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  32.84 
 
 		 304 aa  57  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  27.33 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2559  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 		 318 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2583  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 		 318 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0737  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.46 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.088128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  25.14 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.47 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  29.17 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  28.81 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  27.37 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  27.04 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.47 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.47 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.47 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  27.04 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.47 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0949  phage integrase family protein  27.37 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.427827  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.47 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  27.87 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1313  tyrosine recombinase XerD  28.99 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  28.12 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.12 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.69 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  28.8 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  27.56 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  28.21 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  26.32 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  30.83 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>