More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1423 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  100 
 
 		 119 aa  243  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  62.18 
 
 		 119 aa  167  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  56.3 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  51.69 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  54.62 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  54.62 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 120 aa  135  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  47.46 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  49.58 
 
 		 121 aa  133  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  47.9 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 121 aa  126  8.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 121 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 121 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 121 aa  123  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  46.55 
 
 		 125 aa  120  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 121 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 122 aa  116  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 122 aa  116  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  47.22 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  44.07 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 125 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0717  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 115 aa  113  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  43.48 
 
 		 121 aa  110  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 120 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  41.74 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  44.07 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  43.7 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 121 aa  105  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  40.68 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  41.18 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  40.34 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 234 aa  101  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  40.68 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  39.83 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.07 
 
 		 235 aa  98.6  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 227 aa  99.4  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 229 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 227 aa  98.6  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  43.36 
 
 		 525 aa  98.2  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1842  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 122 aa  98.2  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.808404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  37.82 
 
 		 121 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  38.66 
 
 		 121 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  38.66 
 
 		 121 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  37.82 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.79 
 
 		 230 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 233 aa  95.5  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 229 aa  95.9  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 225 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 236 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  39.45 
 
 		 229 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0579  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  35.59 
 
 		 233 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0503015  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0785  DNA-binding response regulator PhoB  35.59 
 
 		 233 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2853  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 233 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1490  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  35.59 
 
 		 233 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72233  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1296  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  35.59 
 
 		 233 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1623  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  35.59 
 
 		 233 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1194  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 233 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159741  normal  0.484581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0887  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 233 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  0.0397846 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4448  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 233 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 229 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2768  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  35.59 
 
 		 233 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.368066  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  40.37 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1520  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  35.59 
 
 		 233 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1271  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 233 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.624894  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0824  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 233 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2015  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 233 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0572  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  35.59 
 
 		 233 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 239 aa  92.8  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1182  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 233 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1305  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 233 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>