More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2236 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2236  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
547 aa  1100    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0669965  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5711  extracellular solute-binding protein family 5  40.53 
 
 
550 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4848  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  39.47 
 
 
539 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5706  extracellular solute-binding protein family 5  39.4 
 
 
552 aa  356  5.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6175  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  37.95 
 
 
541 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5044  extracellular solute-binding protein family 5  38.59 
 
 
566 aa  323  7e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  29.5 
 
 
519 aa  166  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3349  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 
559 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109598  normal  0.0359992 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.82 
 
 
534 aa  159  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  28.44 
 
 
517 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
541 aa  153  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2114  extracellular solute-binding protein family 5  28.63 
 
 
538 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.59472  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5265  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  28.6 
 
 
515 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154423  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.07 
 
 
532 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 
510 aa  150  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 
495 aa  149  9e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.61 
 
 
513 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.71 
 
 
535 aa  140  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0750  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  24.9 
 
 
559 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  25 
 
 
524 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 
559 aa  134  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  28.77 
 
 
533 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27 
 
 
510 aa  133  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.97 
 
 
520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 
528 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 
528 aa  131  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
508 aa  131  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  27.8 
 
 
540 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  28.38 
 
 
533 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
534 aa  129  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.09 
 
 
540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 
500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  28.02 
 
 
562 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
489 aa  129  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.88 
 
 
516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 
565 aa  127  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 
540 aa  127  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  27.62 
 
 
495 aa  127  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.64 
 
 
540 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  25.64 
 
 
512 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 
535 aa  126  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0232  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 
517 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  25.64 
 
 
512 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  25.64 
 
 
512 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  25.64 
 
 
512 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  25.64 
 
 
512 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
513 aa  126  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.12 
 
 
530 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  25.15 
 
 
513 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  27.82 
 
 
537 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  26.72 
 
 
502 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  27.77 
 
 
535 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 
530 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3427  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
526 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  25.56 
 
 
576 aa  124  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.02 
 
 
546 aa  123  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  26.02 
 
 
528 aa  123  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.37 
 
 
539 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 
511 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1235  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.62 
 
 
542 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650831  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  26.53 
 
 
509 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 
510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.64 
 
 
540 aa  121  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 
535 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.95 
 
 
520 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 
544 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.19 
 
 
509 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2885  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 
528 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128734  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  23.9 
 
 
505 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 
495 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  25.74 
 
 
520 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  24.51 
 
 
515 aa  120  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 
539 aa  120  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  25.53 
 
 
517 aa  120  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6371  extracellular solute-binding protein family 5  25.17 
 
 
504 aa  120  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 
498 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  27.55 
 
 
509 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  25.99 
 
 
502 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.25 
 
 
505 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6191  extracellular solute-binding protein family 5  25.17 
 
 
504 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172417  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  28.21 
 
 
526 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 
495 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  28.21 
 
 
522 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
538 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  27.56 
 
 
528 aa  117  5e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3648  extracellular solute-binding protein family 5  29.78 
 
 
556 aa  117  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
539 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 
521 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  26.48 
 
 
527 aa  117  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 
495 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  26.7 
 
 
532 aa  117  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
520 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.4 
 
 
538 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  28.42 
 
 
525 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.35 
 
 
521 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.35 
 
 
521 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 
521 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.35 
 
 
521 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  28.78 
 
 
531 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>