139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1245 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1245  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 
309 aa  595  1e-169  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.160346  normal  0.403174 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1694  triple helix repeat-containing collagen  73.72 
 
 
1148 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0879  Collagen triple helix repeat protein  62.04 
 
 
328 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2459  Collagen triple helix repeat protein  47.15 
 
 
342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00356575 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  44.52 
 
 
712 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  40.22 
 
 
274 aa  88.6  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  47.83 
 
 
2851 aa  87.4  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  40.45 
 
 
426 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  40.56 
 
 
400 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  37.08 
 
 
390 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  39.66 
 
 
462 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  56.99 
 
 
585 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  54.46 
 
 
835 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  33.33 
 
 
474 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  55.91 
 
 
643 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  58.16 
 
 
813 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.32 
 
 
689 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  35.14 
 
 
459 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  36.62 
 
 
300 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  53.06 
 
 
582 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  53.26 
 
 
434 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  55.06 
 
 
451 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  55.06 
 
 
437 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  55.06 
 
 
437 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  57.14 
 
 
478 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  53.85 
 
 
439 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  60.22 
 
 
1580 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  49.02 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  53.85 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  59.38 
 
 
512 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  39.64 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  39.64 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  45.97 
 
 
438 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  49.04 
 
 
2914 aa  73.2  0.000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  47.52 
 
 
523 aa  72.4  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  39.85 
 
 
403 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  54.84 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3431  hypothetical protein  54.88 
 
 
557 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4499  Collagen triple helix repeat protein  42.18 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0524945  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1848  Collagen triple helix repeat protein  47.5 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  46.94 
 
 
706 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  49.52 
 
 
842 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  52.94 
 
 
466 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  54.55 
 
 
645 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  52.94 
 
 
468 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  36.59 
 
 
481 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  46.08 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  34.71 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  50.53 
 
 
835 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  52.33 
 
 
1426 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  44.9 
 
 
524 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  50 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  42.86 
 
 
582 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  41.98 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  47.62 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  31.98 
 
 
258 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  46.23 
 
 
815 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  42.86 
 
 
587 aa  65.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  53.42 
 
 
366 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  56.18 
 
 
606 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  40.22 
 
 
717 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  48.39 
 
 
542 aa  64.7  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  47.92 
 
 
835 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  54.17 
 
 
1147 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  46.23 
 
 
1055 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  46.15 
 
 
934 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  53.76 
 
 
1168 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  54.55 
 
 
748 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  46.94 
 
 
838 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  33.71 
 
 
382 aa  63.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  44.25 
 
 
867 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  50.59 
 
 
492 aa  63.2  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  52.17 
 
 
222 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  50.56 
 
 
639 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  37.5 
 
 
436 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  44.62 
 
 
1101 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  48.86 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  54.55 
 
 
1321 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  35.03 
 
 
442 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  46.02 
 
 
951 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4764  hypothetical protein  37.06 
 
 
249 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0280415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  32.26 
 
 
469 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  47.17 
 
 
936 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3604  triple helix repeat-containing collagen  34.21 
 
 
385 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  44.86 
 
 
767 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  47.25 
 
 
493 aa  60.1  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  44.57 
 
 
473 aa  60.1  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  48.35 
 
 
252 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  50 
 
 
285 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 
253 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  49.43 
 
 
1219 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  46.15 
 
 
1170 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  32.26 
 
 
647 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  32.62 
 
 
240 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  49.5 
 
 
1451 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3339  triple helix repeat-containing collagen  39.82 
 
 
158 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.487784  normal  0.022781 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  46.88 
 
 
297 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  48.54 
 
 
1873 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  31.58 
 
 
295 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  48.91 
 
 
1297 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>