More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6416 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 617 aa  1276    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  41.72 
 
 		 615 aa  505  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  31.32 
 
 		 605 aa  266  7e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  30.11 
 
 		 599 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  28.91 
 
 		 612 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  31.39 
 
 		 602 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  28.68 
 
 		 619 aa  224  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3220  Rhs element Vgr protein  29.34 
 
 		 618 aa  220  7e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  28.81 
 
 		 602 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  29.47 
 
 		 616 aa  210  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  28.38 
 
 		 576 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  26.67 
 
 		 593 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  24.02 
 
 		 592 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  25.77 
 
 		 587 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  25.31 
 
 		 589 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  22.22 
 
 		 646 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  22.06 
 
 		 643 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  23.71 
 
 		 661 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  23.53 
 
 		 661 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  23.53 
 
 		 661 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  23.53 
 
 		 661 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  23.53 
 
 		 661 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  23.53 
 
 		 661 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  23.71 
 
 		 661 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  22.98 
 
 		 661 aa  104  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  21.48 
 
 		 689 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  24.32 
 
 		 574 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  25.87 
 
 		 618 aa  102  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  26.43 
 
 		 641 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  25.05 
 
 		 668 aa  101  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  21.3 
 
 		 689 aa  100  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  23.33 
 
 		 741 aa  99.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  23.33 
 
 		 741 aa  98.6  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  23.6 
 
 		 578 aa  97.8  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  22.38 
 
 		 755 aa  97.4  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  22.2 
 
 		 687 aa  97.4  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  22.2 
 
 		 687 aa  97.4  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  22.2 
 
 		 687 aa  97.4  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  29.41 
 
 		 218 aa  97.1  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  22.08 
 
 		 756 aa  96.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  26.65 
 
 		 706 aa  96.3  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  22.59 
 
 		 723 aa  96.3  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  23.02 
 
 		 907 aa  96.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  23.62 
 
 		 778 aa  95.9  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  22.89 
 
 		 743 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  25.74 
 
 		 669 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  30.73 
 
 		 248 aa  95.5  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  23.13 
 
 		 725 aa  95.1  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  26.22 
 
 		 697 aa  94.7  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  20.76 
 
 		 741 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  22.53 
 
 		 709 aa  94  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  22.71 
 
 		 975 aa  94  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  27.17 
 
 		 668 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  22.9 
 
 		 589 aa  93.2  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  24.06 
 
 		 614 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  23.78 
 
 		 680 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  20.55 
 
 		 741 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  23.27 
 
 		 730 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  21.48 
 
 		 741 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  21.33 
 
 		 788 aa  92.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  23.04 
 
 		 729 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  25.63 
 
 		 619 aa  92  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  22.74 
 
 		 769 aa  91.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  22.76 
 
 		 774 aa  91.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  24.8 
 
 		 633 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  23.92 
 
 		 713 aa  90.9  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  24.8 
 
 		 633 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  22.73 
 
 		 572 aa  90.9  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  23.54 
 
 		 633 aa  90.9  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  23.04 
 
 		 729 aa  90.9  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  22.52 
 
 		 589 aa  90.5  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  22.46 
 
 		 735 aa  90.5  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1638  type VI secretion system Vgr family protein  23.65 
 
 		 702 aa  90.5  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674786  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  22.79 
 
 		 730 aa  90.1  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  22.71 
 
 		 618 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  23.46 
 
 		 680 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  22.97 
 
 		 619 aa  90.1  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  22.53 
 
 		 748 aa  89.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  23.68 
 
 		 684 aa  89  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3043  type VI secretion system Vgr family protein  23.01 
 
 		 611 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313865  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  23.33 
 
 		 886 aa  89  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  24.25 
 
 		 633 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  22.6 
 
 		 692 aa  88.6  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  22.53 
 
 		 683 aa  88.6  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  21 
 
 		 785 aa  88.6  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  22.38 
 
 		 841 aa  88.6  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  21.76 
 
 		 680 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  23.92 
 
 		 704 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  23.18 
 
 		 565 aa  88.2  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  21.29 
 
 		 693 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  22.86 
 
 		 617 aa  88.2  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  25.38 
 
 		 702 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  25.67 
 
 		 610 aa  87.8  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  21.33 
 
 		 732 aa  87.4  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  22.36 
 
 		 702 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  23.54 
 
 		 753 aa  87  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  23.59 
 
 		 641 aa  87  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  21.62 
 
 		 613 aa  87  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  22.25 
 
 		 794 aa  87  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  25.07 
 
 		 702 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>