More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5055 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5055  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  257  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000148317  normal  0.0527856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1220  CheY-like response regulator  38.1 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0243191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3183  response regulator receiver protein  41.56 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  32.5 
 
 		 229 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  32.5 
 
 		 229 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 1177 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  32.5 
 
 		 229 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001059  putative two-component response regulator  30.83 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  33.6 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  34.71 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.71 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.71 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  31.67 
 
 		 229 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 935 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  30.83 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  31.67 
 
 		 229 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  32.77 
 
 		 705 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 1937 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  29.27 
 
 		 303 aa  61.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 520 aa  60.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 945 aa  60.5  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4337  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  hitchhiker  0.000570677 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3340  response regulator receiver  31.07 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 1977 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.83 
 
 		 1180 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3596  two component transcriptional regulator  30.83 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6438  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.48 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00615091  normal  0.383003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1734  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35 
 
 		 461 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  31.09 
 
 		 705 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2152  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.51 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0525986 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 823 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2389  response regulator receiver domain-containing protein  31.09 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.589748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3692  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 300 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3383  response regulator receiver  37.04 
 
 		 300 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3470  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.68 
 
 		 345 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.4407  normal  0.68065 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0692  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.51 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.370043  unclonable  0.00000000838432 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2655  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  30.25 
 
 		 353 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1934  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 476 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808753  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  28.33 
 
 		 236 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0497  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  37.63 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1791  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3574  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.8 
 
 		 301 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0249095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3838  response regulator receiver domain-containing protein  31.67 
 
 		 234 aa  57.4  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000539223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 509 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1828  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000105938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0063  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.58 
 
 		 357 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.56416e-22 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1732  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  30 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 1954 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0080  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.58 
 
 		 357 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  39.76 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 702 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  29.66 
 
 		 227 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0591  two component LuxR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477799  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  29.17 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1849  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.468098  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1464  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000820366  normal  0.014977 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2739  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 451 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.693002  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2798  response regulator receiver  30.16 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.151747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.83 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.62039e-17 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2257  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.81 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0520127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  27.87 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  29.6 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0332  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18020  sigma54-dependent response regulator of C4 dicarboxylate transport, two component; DctD  32.79 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266513  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  32.58 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  33.9 
 
 		 457 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3292  two component transcriptional regulator  31.93 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  32.54 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5047  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  31.09 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2297  putative PAS/PAC sensor protein  29.66 
 
 		 484 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0617558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  29.66 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>