More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2811 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2811  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 117 aa  243  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2331  transcriptional regulator, HxlR family  70.09 
 
 		 122 aa  161  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.582171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  69.16 
 
 		 116 aa  154  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4034  HxlR family transcriptional regulator  55.24 
 
 		 114 aa  127  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.721532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2647  transcriptional regulator, HxlR family  52.04 
 
 		 116 aa  110  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0854787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  42.31 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  43.81 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  43.52 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  46 
 
 		 115 aa  96.7  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  45.36 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  48.51 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  42.45 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  48.45 
 
 		 131 aa  92.8  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  40.95 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  41.38 
 
 		 117 aa  90.9  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 127 aa  90.1  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3126  transcriptional regulator, HxlR family  43.93 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  41.35 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  40.2 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  39.22 
 
 		 112 aa  84.3  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6707  transcriptional regulator, HxlR family  32.41 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  43.33 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  38 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  34.75 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  35.24 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  41.3 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  41.3 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  43.82 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  41.41 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  40.22 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  39.13 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  44.44 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  39.13 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  39.13 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  43.33 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  40.22 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  36.21 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  36.89 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  42.22 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  40.22 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  41.11 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  40.45 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  37 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  37 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  38.38 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  38.38 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  41.57 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  38.46 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  40 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  38.2 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  37.36 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  37 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  37.62 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  43.01 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  37.17 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  37.36 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  39 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  37.36 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  37.36 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  39.36 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  36.67 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  36.46 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  38.04 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  38.04 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  38.04 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  40.48 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5548  transcriptional regulator, HxlR family  35.87 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>