More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1654 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1654  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 412 aa  819    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1640  major facilitator transporter  56.9 
 
 		 412 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000762127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3237  major facilitator superfamily MFS_1  55.77 
 
 		 418 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0514  major facilitator transporter  55.96 
 
 		 412 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2478  major facilitator superfamily MFS_1  56.33 
 
 		 415 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.496418  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0429  major facilitator superfamily MFS_1  55.77 
 
 		 413 aa  409  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2161  major facilitator superfamily MFS_1  53.9 
 
 		 407 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  0.722113 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0150  hypothetical protein  55.72 
 
 		 413 aa  405  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00771241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0627  major facilitator superfamily MFS_1  55.28 
 
 		 417 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000123626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2840  major facilitator superfamily MFS_1  54.46 
 
 		 415 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1741  major facilitator superfamily MFS_1  56.08 
 
 		 415 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0221  major facilitator transporter  56.44 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4615  major facilitator superfamily MFS_1  50.5 
 
 		 413 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2725  major facilitator superfamily permease  52.13 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.649014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4712  major facilitator superfamily MFS_1  53.81 
 
 		 420 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4757  major facilitator superfamily MFS_1  51.73 
 
 		 413 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0254907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3632  major facilitator superfamily MFS_1  52.21 
 
 		 422 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.361546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0219  major facilitator superfamily MFS_1  54.22 
 
 		 415 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0230  major facilitator superfamily MFS_1  53.96 
 
 		 415 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0206  major facilitator superfamily transporter  53.71 
 
 		 415 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2949  major facilitator superfamily MFS_1  49.51 
 
 		 413 aa  349  6e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3636  major facilitator superfamily MFS_1  49.64 
 
 		 411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.138317  normal  0.90769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3633  major facilitator superfamily MFS_1  43.58 
 
 		 415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 425 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 425 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  29.55 
 
 		 496 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 402 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  30 
 
 		 495 aa  93.6  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  29.55 
 
 		 496 aa  93.2  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0319  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 474 aa  93.2  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.230741  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  29.55 
 
 		 496 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  29.55 
 
 		 496 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  29.55 
 
 		 496 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  28.64 
 
 		 496 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  28.64 
 
 		 496 aa  87  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  28.64 
 
 		 496 aa  87  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  28.64 
 
 		 496 aa  87  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  28.64 
 
 		 496 aa  87  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  28.64 
 
 		 496 aa  87  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  28.64 
 
 		 496 aa  87  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  28.64 
 
 		 496 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  28.64 
 
 		 496 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  23.36 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.03 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  25.87 
 
 		 433 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  25.33 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  25.33 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  25.16 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  25.33 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.76 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  25.87 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  25.87 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  33.83 
 
 		 487 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1383  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277441  normal  0.495047 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  31.66 
 
 		 472 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 472 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.77 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 475 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1447  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110143  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  25.28 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5911  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 480 aa  73.9  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  27.54 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  27.54 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  27.54 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  32.34 
 
 		 472 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0013  putative permease  26.9 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  25.56 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 472 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1996  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.512683 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  27.04 
 
 		 510 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  27.04 
 
 		 510 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>