More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1741 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3237  major facilitator superfamily MFS_1  76.81 
 
 		 418 aa  636    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1741  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 415 aa  815    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2478  major facilitator superfamily MFS_1  96.63 
 
 		 415 aa  749    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.496418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1640  major facilitator transporter  73.24 
 
 		 412 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000762127  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0514  major facilitator transporter  71.53 
 
 		 412 aa  571  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0627  major facilitator superfamily MFS_1  73.06 
 
 		 417 aa  556  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000123626  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0429  major facilitator superfamily MFS_1  71.05 
 
 		 413 aa  542  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0150  hypothetical protein  68.93 
 
 		 413 aa  532  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00771241  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2840  major facilitator superfamily MFS_1  58.21 
 
 		 415 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4757  major facilitator superfamily MFS_1  55.93 
 
 		 413 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0254907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2161  major facilitator superfamily MFS_1  54.86 
 
 		 407 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  0.722113 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1654  major facilitator superfamily MFS_1  56.08 
 
 		 412 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0221  major facilitator transporter  58.31 
 
 		 419 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255633 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0219  major facilitator superfamily MFS_1  58.11 
 
 		 415 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0206  major facilitator superfamily transporter  58.35 
 
 		 415 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0230  major facilitator superfamily MFS_1  57.87 
 
 		 415 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4615  major facilitator superfamily MFS_1  51.48 
 
 		 413 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2725  major facilitator superfamily permease  51.41 
 
 		 425 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.649014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4712  major facilitator superfamily MFS_1  53.16 
 
 		 420 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3632  major facilitator superfamily MFS_1  52.38 
 
 		 422 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.361546 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2949  major facilitator superfamily MFS_1  52.22 
 
 		 413 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3633  major facilitator superfamily MFS_1  47.8 
 
 		 415 aa  358  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3636  major facilitator superfamily MFS_1  52.99 
 
 		 411 aa  357  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.138317  normal  0.90769 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 436 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 399 aa  88.2  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0319  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 474 aa  87.4  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.230741  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 451 aa  86.3  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  25.87 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  23.92 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  23.92 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  23.46 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  23.68 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  23.68 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  23.68 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  23.68 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  23.7 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  32.98 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  32.98 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  32.98 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  32.98 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  31.75 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  32.98 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  32.98 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  23.44 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  32.98 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  30.23 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  30.23 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  30.23 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  30.23 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  30.37 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  29.77 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  24.24 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  24.75 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 425 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0457  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0936  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 492 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 492 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5089  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177988  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.27 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  29.1 
 
 		 510 aa  73.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  29.1 
 
 		 510 aa  73.9  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.96 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 484 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>