More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0627 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0627  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 417 aa  824    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000123626  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0150  hypothetical protein  81.84 
 
 		 413 aa  646    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00771241  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0514  major facilitator transporter  86.8 
 
 		 412 aa  699    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0429  major facilitator superfamily MFS_1  84.35 
 
 		 413 aa  652    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1640  major facilitator transporter  72.4 
 
 		 412 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000762127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3237  major facilitator superfamily MFS_1  70.07 
 
 		 418 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2478  major facilitator superfamily MFS_1  72.82 
 
 		 415 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.496418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1741  major facilitator superfamily MFS_1  73.06 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2840  major facilitator superfamily MFS_1  59.21 
 
 		 415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2161  major facilitator superfamily MFS_1  52.99 
 
 		 407 aa  432  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  0.722113 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0221  major facilitator transporter  59.37 
 
 		 419 aa  425  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4757  major facilitator superfamily MFS_1  55.37 
 
 		 413 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0254907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1654  major facilitator superfamily MFS_1  55.28 
 
 		 412 aa  411  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0206  major facilitator superfamily transporter  59.9 
 
 		 415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0230  major facilitator superfamily MFS_1  59.38 
 
 		 415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0219  major facilitator superfamily MFS_1  59.64 
 
 		 415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2725  major facilitator superfamily permease  52.51 
 
 		 425 aa  388  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.649014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4712  major facilitator superfamily MFS_1  54.25 
 
 		 420 aa  382  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4615  major facilitator superfamily MFS_1  50.49 
 
 		 413 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2949  major facilitator superfamily MFS_1  51.23 
 
 		 413 aa  376  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3632  major facilitator superfamily MFS_1  51.8 
 
 		 422 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.361546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3636  major facilitator superfamily MFS_1  51.72 
 
 		 411 aa  352  8e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.138317  normal  0.90769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3633  major facilitator superfamily MFS_1  47.79 
 
 		 415 aa  344  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 436 aa  89.7  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 440 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0457  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 440 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0936  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 440 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 406 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 406 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 446 aa  87  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 406 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 440 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 		 451 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.92 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.92 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  27.92 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  27.92 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.92 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.92 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.92 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  30.54 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  31.02 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  29.28 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  26.71 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.61 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  29.28 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  31.02 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  31.02 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  31.02 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  31.02 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  31.02 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  30 
 
 		 495 aa  80.5  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  28.64 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  28.64 
 
 		 496 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  28.64 
 
 		 496 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  28.64 
 
 		 496 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 480 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  28.18 
 
 		 496 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0013  putative permease  26.37 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 490 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  32.61 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 425 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 398 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  32.61 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  32.61 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  30.46 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  32.61 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  32.61 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  28.18 
 
 		 496 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  28.18 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  28.18 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  28.18 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  28.18 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  30.11 
 
 		 526 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  28.18 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  28.18 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>