More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2161 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2161  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 407 aa  801    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  0.722113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3237  major facilitator superfamily MFS_1  54.43 
 
 		 418 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1640  major facilitator transporter  53.48 
 
 		 412 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000762127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2840  major facilitator superfamily MFS_1  55.58 
 
 		 415 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0514  major facilitator transporter  53.48 
 
 		 412 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0429  major facilitator superfamily MFS_1  55.72 
 
 		 413 aa  414  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0150  hypothetical protein  54.23 
 
 		 413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00771241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2478  major facilitator superfamily MFS_1  54.86 
 
 		 415 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.496418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0627  major facilitator superfamily MFS_1  52.99 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000123626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4757  major facilitator superfamily MFS_1  53.05 
 
 		 413 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0254907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2725  major facilitator superfamily permease  53.45 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.649014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1741  major facilitator superfamily MFS_1  54.86 
 
 		 415 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1654  major facilitator superfamily MFS_1  53.9 
 
 		 412 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4712  major facilitator superfamily MFS_1  54.94 
 
 		 420 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2949  major facilitator superfamily MFS_1  50.49 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0206  major facilitator superfamily transporter  52.7 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0230  major facilitator superfamily MFS_1  52.7 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0221  major facilitator transporter  52.78 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255633 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0219  major facilitator superfamily MFS_1  52.7 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3632  major facilitator superfamily MFS_1  53.12 
 
 		 422 aa  362  7.0000000000000005e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.361546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3633  major facilitator superfamily MFS_1  50.51 
 
 		 415 aa  360  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4615  major facilitator superfamily MFS_1  46.55 
 
 		 413 aa  354  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3636  major facilitator superfamily MFS_1  51.37 
 
 		 411 aa  338  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.138317  normal  0.90769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0319  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 474 aa  80.5  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.230741  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 451 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  31.64 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  31.64 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  31.41 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  31.64 
 
 		 451 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  31.64 
 
 		 451 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  31.64 
 
 		 451 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  31.64 
 
 		 451 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  31.64 
 
 		 451 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  31.41 
 
 		 399 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  31.41 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  31.41 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  31.41 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  31.41 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6160  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730505  normal  0.770759 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  31.41 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  30.46 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  28.26 
 
 		 496 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  28.26 
 
 		 496 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  28.26 
 
 		 496 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  28.26 
 
 		 496 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  29.89 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  28.21 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  28.21 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  28.21 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0717  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 530 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320017 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  28.26 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  28.26 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  28.26 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4433  amino acid MFS transporter  25.87 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  28.26 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  28.26 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  28.26 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  28.26 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  27.83 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3777  general substrate transporter  25.85 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  31.64 
 
 		 579 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  32.56 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.61 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  30.57 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  30.57 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 432 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 451 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  27.83 
 
 		 496 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  28.09 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2702  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  27.83 
 
 		 496 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.3 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  32.18 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  34.9 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  27.44 
 
 		 500 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>