More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3632 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3632  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 422 aa  839    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.361546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4712  major facilitator superfamily MFS_1  72.14 
 
 		 420 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2949  major facilitator superfamily MFS_1  67.95 
 
 		 413 aa  542  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3636  major facilitator superfamily MFS_1  63.95 
 
 		 411 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.138317  normal  0.90769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3237  major facilitator superfamily MFS_1  54.74 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4615  major facilitator superfamily MFS_1  54.17 
 
 		 413 aa  435  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2840  major facilitator superfamily MFS_1  52.37 
 
 		 415 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3633  major facilitator superfamily MFS_1  54.09 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0514  major facilitator transporter  55.67 
 
 		 412 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2161  major facilitator superfamily MFS_1  53.12 
 
 		 407 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  0.722113 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1640  major facilitator transporter  50.6 
 
 		 412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000762127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2478  major facilitator superfamily MFS_1  52.14 
 
 		 415 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.496418  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0429  major facilitator superfamily MFS_1  52.28 
 
 		 413 aa  393  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4757  major facilitator superfamily MFS_1  50.71 
 
 		 413 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0254907 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0150  hypothetical protein  50.84 
 
 		 413 aa  390  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00771241  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1654  major facilitator superfamily MFS_1  52.21 
 
 		 412 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0627  major facilitator superfamily MFS_1  51.8 
 
 		 417 aa  383  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000123626  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1741  major facilitator superfamily MFS_1  52.38 
 
 		 415 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0221  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 419 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255633 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2725  major facilitator superfamily permease  51.11 
 
 		 425 aa  353  4e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.649014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0219  major facilitator superfamily MFS_1  52.15 
 
 		 415 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0230  major facilitator superfamily MFS_1  51.9 
 
 		 415 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0206  major facilitator superfamily transporter  51.39 
 
 		 415 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  27.53 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  28.18 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  27.25 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  27.25 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  27.25 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  27.03 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  31.28 
 
 		 496 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  33.67 
 
 		 496 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  30.84 
 
 		 496 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  31.28 
 
 		 496 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  26.36 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  36.03 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  31.28 
 
 		 496 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  26.04 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  26.44 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  29.82 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  29.39 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  36.03 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  29.82 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  29.82 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  29.82 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  29.82 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  29.82 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  29.82 
 
 		 496 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  29.82 
 
 		 496 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  26.2 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  26.2 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  26.2 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  26.2 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  26.2 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  31.14 
 
 		 495 aa  72.4  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  25.96 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  25.96 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  26.15 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  24.94 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  26.15 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  30.48 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 451 aa  71.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6160  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730505  normal  0.770759 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  25.83 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5089  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177988  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  27.53 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  32.54 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  32.54 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  28.82 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1383  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277441  normal  0.495047 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  32.54 
 
 		 510 aa  67  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 456 aa  67  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 452 aa  66.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0708  4-hydroxybenzoate transporter, putative  26.6 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0289026  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2816  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  24.94 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>