More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0230 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0230  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
415 aa  801    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0206  major facilitator superfamily transporter  98.8 
 
 
415 aa  795    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0219  major facilitator superfamily MFS_1  99.28 
 
 
415 aa  795    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0221  major facilitator transporter  75.12 
 
 
419 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.255633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1640  major facilitator transporter  57.75 
 
 
412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000762127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3237  major facilitator superfamily MFS_1  57.83 
 
 
418 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0514  major facilitator transporter  58.44 
 
 
412 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0429  major facilitator superfamily MFS_1  58.29 
 
 
413 aa  418  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2478  major facilitator superfamily MFS_1  57.38 
 
 
415 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.496418  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0150  hypothetical protein  58.35 
 
 
413 aa  413  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00771241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0627  major facilitator superfamily MFS_1  58.19 
 
 
417 aa  413  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000123626  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2161  major facilitator superfamily MFS_1  52.66 
 
 
407 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  0.722113 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1741  major facilitator superfamily MFS_1  57.87 
 
 
415 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2840  major facilitator superfamily MFS_1  54.13 
 
 
415 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264249  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1654  major facilitator superfamily MFS_1  53.14 
 
 
412 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4757  major facilitator superfamily MFS_1  49.76 
 
 
413 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0254907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2949  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 
413 aa  347  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2725  major facilitator superfamily permease  48.94 
 
 
425 aa  346  5e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.649014  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4615  major facilitator superfamily MFS_1  47.46 
 
 
413 aa  342  7e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4712  major facilitator superfamily MFS_1  49.76 
 
 
420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646175  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3632  major facilitator superfamily MFS_1  52.37 
 
 
422 aa  336  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.361546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3636  major facilitator superfamily MFS_1  52.03 
 
 
411 aa  330  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.138317  normal  0.90769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3633  major facilitator superfamily MFS_1  43.07 
 
 
415 aa  284  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  25.98 
 
 
425 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  25.98 
 
 
425 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  35.25 
 
 
481 aa  87  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.65 
 
 
442 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 
447 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  28.57 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0936  major facilitator transporter  29.18 
 
 
440 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0457  major facilitator transporter  29.18 
 
 
440 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  34.42 
 
 
476 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  31.58 
 
 
504 aa  84  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
398 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  28.9 
 
 
440 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  26.41 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  28.47 
 
 
436 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  27.96 
 
 
412 aa  82.8  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1996  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 
485 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.512683 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  27.92 
 
 
440 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 
492 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  33.09 
 
 
492 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  31.33 
 
 
480 aa  81.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  27.91 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  36.09 
 
 
402 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  26.7 
 
 
428 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  33.81 
 
 
490 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 
463 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  34.53 
 
 
494 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 
484 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  27.73 
 
 
438 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  26.3 
 
 
407 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2604  major facilitator transporter  38.89 
 
 
467 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.792684  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 
446 aa  79  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0319  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
474 aa  79  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.230741  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5911  major facilitator transporter  38.19 
 
 
487 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  30.04 
 
 
416 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1969  major facilitator transporter  38.89 
 
 
467 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364305  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2580  major facilitator transporter  38.89 
 
 
467 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0717  major facilitator transporter  36.81 
 
 
530 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.320017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  26.85 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2499  major facilitator transporter  37.5 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2628  major facilitator transporter  37.5 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  28.7 
 
 
495 aa  76.6  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  32.37 
 
 
411 aa  76.6  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
597 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  25.81 
 
 
418 aa  76.6  0.0000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  33.09 
 
 
488 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  27.09 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2702  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 
445 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  27.25 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  28.15 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  28.08 
 
 
429 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  28.53 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  29.06 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  32.89 
 
 
438 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  31.1 
 
 
526 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  26.35 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  29.06 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0464  general substrate transporter  27.27 
 
 
436 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  26.35 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  26.35 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  27.09 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  30.24 
 
 
429 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  25.95 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  26.46 
 
 
467 aa  74.7  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  24.25 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  27.45 
 
 
491 aa  74.7  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  26.04 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  26.04 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  26.04 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  26.04 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  25.63 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  26.04 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  26.04 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  28.61 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>