More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4757 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4757  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 413 aa  813    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0254907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2840  major facilitator superfamily MFS_1  73.28 
 
 		 415 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3237  major facilitator superfamily MFS_1  55.45 
 
 		 418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1640  major facilitator transporter  55.26 
 
 		 412 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000762127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2478  major facilitator superfamily MFS_1  55.69 
 
 		 415 aa  431  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.496418  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0514  major facilitator transporter  55.75 
 
 		 412 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2161  major facilitator superfamily MFS_1  53.05 
 
 		 407 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  0.722113 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0150  hypothetical protein  56.83 
 
 		 413 aa  413  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00771241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1741  major facilitator superfamily MFS_1  55.93 
 
 		 415 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0627  major facilitator superfamily MFS_1  55.37 
 
 		 417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000123626  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0429  major facilitator superfamily MFS_1  55.75 
 
 		 413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4712  major facilitator superfamily MFS_1  51.93 
 
 		 420 aa  375  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1654  major facilitator superfamily MFS_1  51.73 
 
 		 412 aa  368  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4615  major facilitator superfamily MFS_1  48.2 
 
 		 413 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2949  major facilitator superfamily MFS_1  49.51 
 
 		 413 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0221  major facilitator transporter  50.97 
 
 		 419 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255633 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3632  major facilitator superfamily MFS_1  50.71 
 
 		 422 aa  363  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.361546 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2725  major facilitator superfamily permease  49.3 
 
 		 425 aa  362  6e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.649014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3633  major facilitator superfamily MFS_1  49.01 
 
 		 415 aa  355  7.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0219  major facilitator superfamily MFS_1  51.41 
 
 		 415 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0206  major facilitator superfamily transporter  51.66 
 
 		 415 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3636  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 		 411 aa  350  4e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.138317  normal  0.90769 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0230  major facilitator superfamily MFS_1  50.9 
 
 		 415 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 398 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 467 aa  89.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 425 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 425 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  33.82 
 
 		 432 aa  87  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  33.82 
 
 		 433 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  33.82 
 
 		 432 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 432 aa  87  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 433 aa  87  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  33.82 
 
 		 433 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  33.82 
 
 		 433 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  35.48 
 
 		 432 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 447 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  27.51 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  26.01 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  26.01 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  26.01 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  26.01 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  26.01 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  26.01 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  26.01 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  26.01 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  26.01 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  28.88 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  28.88 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  27.92 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  28.18 
 
 		 495 aa  80.5  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.6 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  26.64 
 
 		 496 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  26.64 
 
 		 496 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  26.64 
 
 		 496 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  26.64 
 
 		 496 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  33.33 
 
 		 526 aa  77  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  26.64 
 
 		 496 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0319  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.230741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 428 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  25.82 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  25.82 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  25.82 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  25.82 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  25.82 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  25.82 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  25.82 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  25.82 
 
 		 496 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  30.14 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 463 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  25.82 
 
 		 496 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  31.86 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  29.7 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>