More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3636 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3636  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 411 aa  810    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.138317  normal  0.90769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4615  major facilitator superfamily MFS_1  64.32 
 
 		 413 aa  512  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2949  major facilitator superfamily MFS_1  60.92 
 
 		 413 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4712  major facilitator superfamily MFS_1  62.14 
 
 		 420 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3632  major facilitator superfamily MFS_1  63.95 
 
 		 422 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.361546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3633  major facilitator superfamily MFS_1  59.08 
 
 		 415 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2840  major facilitator superfamily MFS_1  54.55 
 
 		 415 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3237  major facilitator superfamily MFS_1  54.11 
 
 		 418 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1640  major facilitator transporter  51.75 
 
 		 412 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000762127  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0514  major facilitator transporter  52.08 
 
 		 412 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2161  major facilitator superfamily MFS_1  51.37 
 
 		 407 aa  381  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  0.722113 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0429  major facilitator superfamily MFS_1  54.17 
 
 		 413 aa  380  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2478  major facilitator superfamily MFS_1  52.49 
 
 		 415 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.496418  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4757  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0254907 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0627  major facilitator superfamily MFS_1  51.72 
 
 		 417 aa  358  7e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000123626  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0150  hypothetical protein  51.23 
 
 		 413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00771241  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1654  major facilitator superfamily MFS_1  49.64 
 
 		 412 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1741  major facilitator superfamily MFS_1  52.99 
 
 		 415 aa  348  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0230  major facilitator superfamily MFS_1  51.55 
 
 		 415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0206  major facilitator superfamily transporter  51.55 
 
 		 415 aa  336  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0219  major facilitator superfamily MFS_1  51.29 
 
 		 415 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0221  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 419 aa  329  7e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255633 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2725  major facilitator superfamily permease  46.67 
 
 		 425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.649014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 428 aa  87  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.29 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  25.78 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  32.52 
 
 		 495 aa  80.1  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  26.84 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5089  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177988  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  25.91 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  25.91 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  32.06 
 
 		 496 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  32.06 
 
 		 496 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  25.91 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  32.06 
 
 		 496 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  32.06 
 
 		 496 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  26.7 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  26.7 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  26.7 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  25.14 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  26.7 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  26.7 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  26.7 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  26.7 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  32.06 
 
 		 496 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  32.07 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  26.7 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  33.33 
 
 		 496 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1076  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.197988  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  27.67 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  33.33 
 
 		 496 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  30.56 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  26.67 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  30.56 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  26.67 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1972  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.106436  hitchhiker  0.000000141049 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  30.56 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  25.79 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.66 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  33.33 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  33.33 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  33.33 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  33.33 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  33.33 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  33.33 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  33.33 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  34.18 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0319  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 474 aa  73.9  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.230741  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  24.72 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  24.72 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  24.72 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0457  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0936  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>