116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1457 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  56.71 
 
 
781 aa  882    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  61.47 
 
 
772 aa  1013    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  64.08 
 
 
782 aa  1031    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  64.61 
 
 
759 aa  1085    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  72.35 
 
 
774 aa  1194    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  68.91 
 
 
758 aa  1138    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 
780 aa  1631    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  47.64 
 
 
755 aa  737    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  65.3 
 
 
760 aa  985    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  37.06 
 
 
1426 aa  487  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  35.92 
 
 
1322 aa  481  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  34.43 
 
 
1114 aa  481  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  36.82 
 
 
1427 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  36.56 
 
 
1422 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  35.57 
 
 
1124 aa  460  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  34.28 
 
 
771 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  35.65 
 
 
759 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  35.19 
 
 
753 aa  418  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  33.16 
 
 
747 aa  416  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  33.38 
 
 
778 aa  412  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  34.2 
 
 
761 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  33.33 
 
 
785 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  32.8 
 
 
976 aa  407  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3003  alpha-1,2-mannosidase  34.31 
 
 
1053 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.671088  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  32.73 
 
 
807 aa  405  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  34.07 
 
 
784 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  33.01 
 
 
784 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  32.58 
 
 
769 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  33.84 
 
 
706 aa  398  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  33.94 
 
 
762 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  33.76 
 
 
754 aa  394  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  32.88 
 
 
777 aa  392  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22340  alpha-1,2-mannosidase, putative  31.94 
 
 
1073 aa  392  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  32.84 
 
 
747 aa  385  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  31.43 
 
 
797 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  32.55 
 
 
771 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  32.49 
 
 
775 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  31 
 
 
827 aa  372  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  31.82 
 
 
742 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  32.49 
 
 
773 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  31.68 
 
 
751 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  31.19 
 
 
757 aa  357  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  30.99 
 
 
795 aa  353  8.999999999999999e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  30.94 
 
 
771 aa  350  4e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  32.35 
 
 
741 aa  350  5e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  31.34 
 
 
1089 aa  346  8.999999999999999e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  31.17 
 
 
790 aa  342  2e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  31.51 
 
 
790 aa  340  5.9999999999999996e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  35.41 
 
 
751 aa  340  9e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1609  alpha-1,2-mannosidase  28.74 
 
 
701 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  30.69 
 
 
1075 aa  334  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  31.17 
 
 
769 aa  332  1e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  32.3 
 
 
728 aa  327  5e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  30.64 
 
 
745 aa  322  9.999999999999999e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  29.63 
 
 
749 aa  315  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00600  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.62 
 
 
912 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749249  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  30.69 
 
 
740 aa  313  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  30.1 
 
 
877 aa  308  3e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  30.58 
 
 
811 aa  308  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  28.85 
 
 
1084 aa  307  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  28.07 
 
 
1189 aa  300  8e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  28.89 
 
 
760 aa  299  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  29.99 
 
 
764 aa  298  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.6 
 
 
753 aa  296  1e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  30.87 
 
 
716 aa  295  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  30.56 
 
 
768 aa  292  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  30.38 
 
 
826 aa  290  7e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  30.62 
 
 
826 aa  290  7e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.81 
 
 
955 aa  288  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.81 
 
 
955 aa  287  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.81 
 
 
986 aa  287  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.81 
 
 
986 aa  287  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.81 
 
 
986 aa  287  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  28.68 
 
 
986 aa  286  8e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.85 
 
 
964 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  28.57 
 
 
821 aa  286  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  28.68 
 
 
986 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  28.23 
 
 
818 aa  283  9e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  28.34 
 
 
943 aa  283  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  28.23 
 
 
818 aa  282  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14540  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.01 
 
 
1034 aa  281  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254996  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  29.35 
 
 
757 aa  281  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.38 
 
 
771 aa  270  7e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  27.53 
 
 
899 aa  268  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  28.19 
 
 
961 aa  267  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  28.59 
 
 
888 aa  265  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  29.28 
 
 
806 aa  259  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  28.93 
 
 
808 aa  257  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.54 
 
 
886 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  28.54 
 
 
886 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  28.54 
 
 
886 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  27.38 
 
 
890 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  26.95 
 
 
901 aa  253  9.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  25.4 
 
 
846 aa  240  5.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06599  hypothetical protein  26.47 
 
 
917 aa  219  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01197  alpha-1,2-mannosidase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10790)  24.94 
 
 
802 aa  217  5e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130412  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  26.33 
 
 
901 aa  216  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  24.85 
 
 
839 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  26.32 
 
 
823 aa  213  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.74 
 
 
819 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>