More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0327 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.01 
 
 		 1403 aa  788    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  36.16 
 
 		 1386 aa  713    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  42.83 
 
 		 1357 aa  687    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  100 
 
 		 1354 aa  2781    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  40.33 
 
 		 1449 aa  643    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  41.55 
 
 		 1362 aa  736    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  39.39 
 
 		 1381 aa  635  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  40.13 
 
 		 1437 aa  633  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  37.04 
 
 		 988 aa  596  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  37.32 
 
 		 1025 aa  592  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  36.33 
 
 		 1284 aa  462  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  38.04 
 
 		 1068 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  37.97 
 
 		 1070 aa  378  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  39.85 
 
 		 1082 aa  378  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 1091 aa  376  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  39.56 
 
 		 1070 aa  375  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  35.05 
 
 		 1068 aa  375  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  34.95 
 
 		 1068 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  39.67 
 
 		 1082 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  39.67 
 
 		 1082 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  41.25 
 
 		 1108 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  39.65 
 
 		 1073 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  42.86 
 
 		 777 aa  372  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  37.13 
 
 		 1087 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  36.62 
 
 		 1021 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.06 
 
 		 982 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  38.1 
 
 		 1062 aa  368  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  36.93 
 
 		 964 aa  370  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  43.92 
 
 		 985 aa  369  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.49 
 
 		 1068 aa  369  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  37.24 
 
 		 1055 aa  367  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  35.61 
 
 		 1071 aa  366  1e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  39.51 
 
 		 1080 aa  364  6e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  37.06 
 
 		 1110 aa  364  7.0000000000000005e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  41.39 
 
 		 876 aa  363  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  39.81 
 
 		 1105 aa  363  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  36.7 
 
 		 1088 aa  363  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.47 
 
 		 1102 aa  363  1e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  39.06 
 
 		 1073 aa  363  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  40.31 
 
 		 666 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  37.41 
 
 		 1031 aa  362  2e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  41.14 
 
 		 914 aa  362  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  43.11 
 
 		 1003 aa  361  5e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  39.64 
 
 		 1077 aa  361  5e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  40.31 
 
 		 1105 aa  361  7e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  37.26 
 
 		 1161 aa  361  7e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  39.06 
 
 		 1073 aa  360  8e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.2 
 
 		 1069 aa  360  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  39.06 
 
 		 1073 aa  360  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.07 
 
 		 1082 aa  360  9.999999999999999e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  40.93 
 
 		 918 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  42.11 
 
 		 896 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.06 
 
 		 933 aa  359  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  38.08 
 
 		 1130 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  40.53 
 
 		 918 aa  359  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  41.74 
 
 		 903 aa  358  3.9999999999999996e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  41.73 
 
 		 663 aa  358  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.99 
 
 		 1082 aa  358  5.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.87 
 
 		 1073 aa  357  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.87 
 
 		 1112 aa  357  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  42.27 
 
 		 872 aa  357  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  40.57 
 
 		 918 aa  356  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  40.33 
 
 		 918 aa  356  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  42.18 
 
 		 773 aa  356  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  40.33 
 
 		 918 aa  356  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  40.33 
 
 		 918 aa  356  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  40.33 
 
 		 918 aa  356  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  40.91 
 
 		 918 aa  355  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  40.33 
 
 		 918 aa  355  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  40.89 
 
 		 1086 aa  355  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  40.12 
 
 		 918 aa  355  5e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  40.12 
 
 		 918 aa  354  5.9999999999999994e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  36.71 
 
 		 924 aa  353  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  40.47 
 
 		 1250 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  40.29 
 
 		 918 aa  353  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  37.67 
 
 		 1154 aa  353  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  44.64 
 
 		 1142 aa  352  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  41.88 
 
 		 1209 aa  351  4e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.39 
 
 		 1129 aa  351  5e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.37 
 
 		 925 aa  351  6e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  39.44 
 
 		 1125 aa  350  8e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  42.55 
 
 		 1164 aa  350  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  37.68 
 
 		 977 aa  350  1e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.18 
 
 		 1160 aa  349  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.33 
 
 		 1104 aa  349  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  39.5 
 
 		 1185 aa  348  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.29 
 
 		 1139 aa  347  6e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.08 
 
 		 1089 aa  347  7e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.49 
 
 		 1261 aa  347  7e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  38.16 
 
 		 1112 aa  346  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.5 
 
 		 1102 aa  346  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  40.84 
 
 		 1134 aa  345  5e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  43.25 
 
 		 621 aa  344  5.999999999999999e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  43.53 
 
 		 1120 aa  343  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.49 
 
 		 1112 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  43.53 
 
 		 1120 aa  342  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  34.69 
 
 		 959 aa  341  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  37.74 
 
 		 1127 aa  341  5e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  36.16 
 
 		 1084 aa  341  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  40.4 
 
 		 1086 aa  340  9.999999999999999e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>