262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0424 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0424  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 171 aa  338  2.9999999999999998e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000721465  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00035  putative 50S ribosomal protein L10  68.79 
 
 		 177 aa  239  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1941  50S ribosomal protein L10  65.64 
 
 		 167 aa  230  9e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136408  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0847  ribosomal protein L10  52.63 
 
 		 173 aa  190  8e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3451  ribosomal protein L10  52.87 
 
 		 176 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00335052  normal  0.0391621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4479  ribosomal protein L10  50.87 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0392  50S ribosomal protein L10  48.28 
 
 		 174 aa  169  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1398  50S ribosomal protein L10  45.81 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  42.77 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1708  ribosomal protein L10  41.07 
 
 		 177 aa  121  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0962108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3171  50S ribosomal protein L10  39.1 
 
 		 167 aa  120  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  31.17 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  29.14 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  32.73 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  26.9 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  34.72 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  32.03 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0194  50S ribosomal protein L10  35.48 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000548969  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  29.88 
 
 		 170 aa  72  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  32.2 
 
 		 172 aa  72  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  34.81 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  29.94 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  29.93 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0357  50S ribosomal protein L10  26.97 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.395491  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  34.62 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  32.93 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  29.82 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  30.46 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  30.46 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  27.98 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  27.91 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  28.83 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0179  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  29.24 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  28.32 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  32.74 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  30.52 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  34.27 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  34.27 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  29.03 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  28.48 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0286  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520195  hitchhiker  0.00386218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  34.27 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  29.48 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  31.21 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  29.48 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  31.11 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  33.06 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  33.06 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  30.23 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  26.74 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  30.23 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  33.57 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  30.97 
 
 		 176 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1318  50S ribosomal protein L10  31.33 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000548659  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  26.9 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  26.4 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  26.4 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  28.21 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  27.88 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  27.78 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0286  ribosomal protein L10  27.45 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  27.49 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  25.97 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  28.49 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1174  50S ribosomal protein L10  30.54 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000920712  normal  0.67375 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  27.54 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  27.54 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  27.93 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  28.25 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  28.57 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  28.16 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  27.27 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0479  ribosomal protein L10  33.1 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  26.9 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0351  ribosomal protein L10  28.85 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0874946  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  28.81 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  28.81 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  28.76 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  31.4 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0172  50S ribosomal protein L10  30 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.33126  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  28.65 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  23.67 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  28.81 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  27.49 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  27.49 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0640  50S ribosomal protein L10  30.41 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2554  50S ribosomal protein L10  27.49 
 
 		 181 aa  57.4  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  29.33 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  30.07 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  30.07 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  28.07 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  30.61 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  30.97 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  31.97 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1038  50S ribosomal protein L10  27.49 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  30.06 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  26.97 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  27.92 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>