More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0351 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0351  ribosomal protein L10  100 
 
 
160 aa  324  4.0000000000000003e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0874946  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1318  50S ribosomal protein L10  62.5 
 
 
161 aa  204  4e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000548659  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0447  50S ribosomal protein L10  59.87 
 
 
159 aa  201  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000981328  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1458  50S ribosomal protein L10  59.24 
 
 
159 aa  200  5e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000221032  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0507  50S ribosomal protein L10  58.6 
 
 
159 aa  200  8e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000655679  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0526  50S ribosomal protein L10  58.6 
 
 
159 aa  199  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.142497  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0351  50S ribosomal protein L10  56.6 
 
 
159 aa  192  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00255818  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0179  50S ribosomal protein L10  56.88 
 
 
161 aa  191  4e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0172  50S ribosomal protein L10  55.62 
 
 
161 aa  189  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.33126  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1665  50S ribosomal protein L10  57.05 
 
 
157 aa  179  2e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.701017  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  36.81 
 
 
170 aa  103  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  32.48 
 
 
166 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  35.42 
 
 
174 aa  101  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 
172 aa  99.4  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
173 aa  99  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  32.2 
 
 
176 aa  98.2  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  33.97 
 
 
166 aa  97.4  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  32.48 
 
 
166 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  36.24 
 
 
172 aa  96.3  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  32.91 
 
 
168 aa  95.5  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  29.94 
 
 
165 aa  95.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  31.45 
 
 
165 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 
175 aa  95.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  31.45 
 
 
165 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  31.45 
 
 
165 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  31.45 
 
 
165 aa  94.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 
167 aa  94.4  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 
167 aa  94.4  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  36.5 
 
 
165 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  36.5 
 
 
165 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  36.5 
 
 
165 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  36.5 
 
 
165 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3180  50S ribosomal protein L10  36.76 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000385503  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  31.33 
 
 
174 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  32.87 
 
 
173 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  36.5 
 
 
184 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  36.5 
 
 
184 aa  93.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  36.5 
 
 
184 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  36.5 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  30.72 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  30.82 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  31.85 
 
 
166 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  31.85 
 
 
166 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  32.57 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  31.65 
 
 
168 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  31.65 
 
 
168 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  30.43 
 
 
174 aa  90.5  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  33.97 
 
 
172 aa  90.1  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  34.84 
 
 
174 aa  89.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  35.04 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  34.46 
 
 
174 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  32.1 
 
 
174 aa  88.6  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0479  ribosomal protein L10  34.19 
 
 
164 aa  88.2  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  34.03 
 
 
176 aa  88.2  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  36.05 
 
 
172 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  32.92 
 
 
171 aa  88.2  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 
174 aa  87.8  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  35.04 
 
 
188 aa  87.8  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  34.44 
 
 
205 aa  87.4  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  32.68 
 
 
172 aa  87  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  33.78 
 
 
174 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  35.81 
 
 
189 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  31.08 
 
 
173 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  31.08 
 
 
173 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  34.48 
 
 
172 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  34.23 
 
 
174 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  33.78 
 
 
174 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  31.06 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  34.69 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 
174 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  31.68 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  33.78 
 
 
181 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  32.89 
 
 
174 aa  85.5  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  34.27 
 
 
195 aa  85.5  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  30.81 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  30.81 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  33.56 
 
 
174 aa  85.1  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  31.06 
 
 
166 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  31.06 
 
 
166 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  31.06 
 
 
166 aa  84.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  31.06 
 
 
166 aa  84.7  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  31.06 
 
 
166 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  31.06 
 
 
166 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  31.06 
 
 
166 aa  84.7  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  32.76 
 
 
172 aa  84.7  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  31.06 
 
 
166 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  34.01 
 
 
172 aa  84.3  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  30.43 
 
 
166 aa  84  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  31.87 
 
 
175 aa  84  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  32.1 
 
 
168 aa  84  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  31.48 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  31.48 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  30.5 
 
 
167 aa  83.6  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  33.12 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  33.33 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0566  50S ribosomal protein L10  32.17 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  33.81 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>