65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1499 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 		 234 aa  476  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  59.48 
 
 		 236 aa  258  4e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  52.81 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  55.65 
 
 		 243 aa  243  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  55.98 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  49.34 
 
 		 234 aa  228  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  45.61 
 
 		 238 aa  215  4e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  49.35 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  49.79 
 
 		 236 aa  211  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  46.9 
 
 		 242 aa  210  1e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  44.78 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  45.41 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  45.38 
 
 		 243 aa  189  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  46.32 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  48.34 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  40 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  39.22 
 
 		 550 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  43.13 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  37.09 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  36.52 
 
 		 238 aa  132  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  28.81 
 
 		 241 aa  85.1  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  27.54 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  28.76 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  26.89 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  26.94 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  30.22 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  36.36 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  28.7 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  28.22 
 
 		 261 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  28.71 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  26.47 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  21.95 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  29.19 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  27.23 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  28.69 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6988  DNA alkylation repair enzyme  28.81 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  26.09 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3013  DNA-7-methylguanine glycosylase  33.61 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  30.7 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  23.85 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  24.75 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1298  hypothetical protein  27.54 
 
 		 235 aa  52.4  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  24.75 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  23.39 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  29.41 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  24.17 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  24.75 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  23.22 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  23.22 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  23.22 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  23.22 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4304  hypothetical protein  28.05 
 
 		 218 aa  48.9  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.648821  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  24.55 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  26.37 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  26.37 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  26.37 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  27.83 
 
 		 229 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2664  hypothetical protein  26.15 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  22.87 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1596  hypothetical protein  27.5 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1132  hypothetical protein  24.06 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  26.55 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  23.89 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_520  hypothetical protein  23.04 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0581  hypothetical protein  23.3 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>