63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0726 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  61.33 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  57.8 
 
 		 234 aa  248  7e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  53.1 
 
 		 227 aa  222  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  26.67 
 
 		 217 aa  72  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  30.94 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  24.37 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  28.3 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  26.79 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  27.68 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  28 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  27.27 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6988  DNA alkylation repair enzyme  33.33 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  24.89 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  25.5 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2310  hypothetical protein  29.44 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3013  DNA-7-methylguanine glycosylase  30 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  26.61 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  20.55 
 
 		 236 aa  51.6  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1132  hypothetical protein  22.43 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110676  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  24.53 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  29.19 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4304  hypothetical protein  23.04 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.648821  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0555  DNA alkylation repair enzyme-like protein  27.21 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  24.47 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  24.05 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  26.15 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2073  hypothetical protein  28.35 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_520  hypothetical protein  26.5 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  28.37 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  24.47 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  25.23 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  31.4 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  31.4 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  31.4 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  25 
 
 		 232 aa  48.5  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  24.05 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  24.05 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  24.05 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  24.05 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  24.05 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  23.53 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  25.74 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0836  hypothetical protein  27.22 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206706 
 
 
-
 
NC_002936  DET0581  hypothetical protein  26.17 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  25.26 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  25.41 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2946  hypothetical protein  29.59 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2986  hypothetical protein  30.61 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000288545  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  23.39 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2940  hypothetical protein  29.59 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6684100000000001e-56 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2941  hypothetical protein  29.59 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000572479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2732  hypothetical protein  29.59 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265845  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  21.43 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  26.11 
 
 		 257 aa  42.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2683  hypothetical protein  29.59 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000553491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  23.04 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  21.15 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2664  hypothetical protein  29.47 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  26.4 
 
 		 241 aa  42.4  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2299  hypothetical protein  29.59 
 
 		 227 aa  42  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0222691  hitchhiker  5.32762e-16 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  26.79 
 
 		 236 aa  42  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  41.6  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>