58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2433 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  65.2 
 
 		 237 aa  288  6e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  54.3 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  48.46 
 
 		 234 aa  185  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  48.46 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  51.48 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  46.19 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  46.19 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  46.19 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  34.39 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  33.48 
 
 		 237 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  38.5 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  33.94 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  33.94 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  33.94 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  33.94 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  33.94 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  32.13 
 
 		 237 aa  121  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  33.5 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  33.03 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  33.48 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  32.11 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6988  DNA alkylation repair enzyme  33.78 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25051  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1132  hypothetical protein  31.39 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110676  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1275  DNA alkylation repair protein  42.19 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0157146  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3013  DNA-7-methylguanine glycosylase  32.62 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2437  DNA-7-methylguanine glycosylase  31.13 
 
 		 210 aa  95.5  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000187196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  30.97 
 
 		 261 aa  92.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  33.62 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  22.91 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  31.72 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  30.94 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  25.44 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  32.16 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  27.11 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  28.51 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  27.57 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  23.01 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  24.23 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  27.27 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  23.85 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  29.47 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  27.75 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  29.91 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  23.58 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  29.58 
 
 		 257 aa  49.3  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  28.31 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  27.14 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  29.01 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  24.86 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  25.91 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  22.89 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  35 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  26.15 
 
 		 550 aa  42.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1596  hypothetical protein  34.74 
 
 		 232 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2073  hypothetical protein  28.92 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2310  hypothetical protein  30.12 
 
 		 227 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2895  HEAT domain containing protein  29.35 
 
 		 367 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.372622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>