39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1009 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  520  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  60.61 
 
 		 236 aa  258  7e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  54.74 
 
 		 243 aa  247  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  53.25 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  55.98 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  55.22 
 
 		 232 aa  245  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  47.41 
 
 		 236 aa  228  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  48.87 
 
 		 242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  44.44 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  49.78 
 
 		 247 aa  207  9e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  45.49 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  47.64 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  44.87 
 
 		 243 aa  191  7e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  47.11 
 
 		 235 aa  188  8e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  43.27 
 
 		 237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  39.8 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  43.66 
 
 		 243 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  37.38 
 
 		 550 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  36.84 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  39.02 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  29.05 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  27.43 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  25 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  26.5 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  29.77 
 
 		 224 aa  72  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  25 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  27.35 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  26.03 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  27.5 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  26.32 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  22.82 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  29.58 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1298  hypothetical protein  25.7 
 
 		 235 aa  48.5  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  35.63 
 
 		 227 aa  48.5  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  27 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  24.88 
 
 		 225 aa  45.8  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  25.73 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  26.75 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  22.9 
 
 		 217 aa  42.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>