58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0298 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  548  1e-155  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  54.79 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  49.57 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  48.29 
 
 		 241 aa  241  7.999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  43.86 
 
 		 250 aa  238  5e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  46.12 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  47.44 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  27.71 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  27.93 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  26.45 
 
 		 251 aa  95.5  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  30.71 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  26.14 
 
 		 232 aa  86.7  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  29.1 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  30.29 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  27.31 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  25 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  26.81 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  27 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  27.43 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  27.39 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  33.86 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  31.01 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  28.89 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  23.65 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  27.39 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  25.69 
 
 		 550 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  29.84 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  24.23 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  25.79 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  24.89 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  24.67 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  24.89 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  24.89 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  28.81 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  24.52 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  22.92 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  23.58 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1988  hypothetical protein  25.41 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  26.15 
 
 		 225 aa  49.7  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  22.52 
 
 		 223 aa  49.7  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1280  hypothetical protein  21.23 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  23.68 
 
 		 223 aa  48.9  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0591  hypothetical protein  54.55 
 
 		 45 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.425982  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  20.45 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  24.34 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  27.35 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  21.76 
 
 		 227 aa  46.6  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  20.54 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  27.35 
 
 		 237 aa  45.8  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  20.54 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  20.54 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  20.54 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  20.54 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  26.5 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  23.21 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1298  hypothetical protein  25.67 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  20.09 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  25.64 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>