47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1238 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 
250 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  59.15 
 
 
224 aa  268  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  49.79 
 
 
236 aa  253  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  49.36 
 
 
240 aa  249  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  46.61 
 
 
241 aa  248  6e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  47.64 
 
 
237 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  43.86 
 
 
263 aa  238  5e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  28.77 
 
 
248 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  27.5 
 
 
245 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  25.21 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  31.75 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  30.04 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  26.7 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  24.88 
 
 
550 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  26.11 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  22.83 
 
 
232 aa  72  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  26.09 
 
 
234 aa  72  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  29.69 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  28.15 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  27.54 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  22.84 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  33.6 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  28.8 
 
 
257 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  24.38 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  28.57 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  25 
 
 
236 aa  62  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  25 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  24.79 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  26.19 
 
 
247 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  22.77 
 
 
243 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  24.12 
 
 
237 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  20.53 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  20.53 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  20.53 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  31.07 
 
 
237 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  23.62 
 
 
237 aa  49.3  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  21.78 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  29.13 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  29.13 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  29.13 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1460  hypothetical protein  25.71 
 
 
230 aa  47.8  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  29.13 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  29.13 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  29.13 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0591  hypothetical protein  50 
 
 
45 aa  45.8  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.425982  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  25.37 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1275  DNA alkylation repair protein  25 
 
 
172 aa  43.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0157146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>