63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4757 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 		 234 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  46.9 
 
 		 236 aa  221  9e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  46.96 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  49.34 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  49.36 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  44.25 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  45.81 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  45.37 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  49.52 
 
 		 247 aa  198  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  45.65 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  43.36 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  44.21 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  46.73 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  43.97 
 
 		 235 aa  188  5e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  43.59 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  42.33 
 
 		 243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  38.86 
 
 		 236 aa  161  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  37.91 
 
 		 550 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  38.94 
 
 		 239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  35.89 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  28.99 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  29.05 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  30.18 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  26.84 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  27.31 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  26.7 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  35.9 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  34.34 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  25.21 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  25.85 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  34.34 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  34.34 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  34.34 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  34.34 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  23.85 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  28.89 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  24.14 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  25.31 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  32.32 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  24.44 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  26.35 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_520  hypothetical protein  23.98 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  28.31 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  23.21 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  24.2 
 
 		 227 aa  48.5  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  23.42 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  34 
 
 		 223 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  24.81 
 
 		 251 aa  45.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  26.27 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  24.24 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2437  DNA-7-methylguanine glycosylase  25.27 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000187196  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3013  DNA-7-methylguanine glycosylase  23.24 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  26.27 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0555  DNA alkylation repair enzyme-like protein  22.34 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6988  DNA alkylation repair enzyme  22.73 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  26.4 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  33.02 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0581  hypothetical protein  23.16 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  27.08 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  23.04 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1132  hypothetical protein  25 
 
 		 219 aa  42.4  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>