59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2183 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 
237 aa  471  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  65.2 
 
 
228 aa  293  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  45.41 
 
 
234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  50 
 
 
223 aa  189  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  49.09 
 
 
227 aa  188  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  48.21 
 
 
229 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  42.6 
 
 
231 aa  164  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  42.6 
 
 
231 aa  164  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  42.6 
 
 
231 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  34.09 
 
 
237 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  34.09 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  34.09 
 
 
237 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  34.09 
 
 
237 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  34.09 
 
 
237 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  33.18 
 
 
237 aa  134  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  34.09 
 
 
237 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  33.64 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  34.09 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  35.48 
 
 
237 aa  132  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  32.42 
 
 
223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  33.5 
 
 
222 aa  123  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1132  hypothetical protein  31.25 
 
 
219 aa  121  9e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  35.1 
 
 
217 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6988  DNA alkylation repair enzyme  34.23 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25051  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3013  DNA-7-methylguanine glycosylase  33.93 
 
 
231 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  30.74 
 
 
261 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1275  DNA alkylation repair protein  41.61 
 
 
172 aa  102  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0157146  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2437  DNA-7-methylguanine glycosylase  32.23 
 
 
210 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000187196  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  30.36 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  26.05 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  25.68 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  24.23 
 
 
263 aa  58.5  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  23.28 
 
 
238 aa  57.8  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  24 
 
 
234 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  25.11 
 
 
234 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  24.27 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  23.85 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  26.2 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  26.96 
 
 
225 aa  52.8  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  25.31 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  33 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  24.55 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  26.13 
 
 
227 aa  50.1  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  21.79 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  28.12 
 
 
234 aa  48.9  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  22.87 
 
 
240 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  23.98 
 
 
242 aa  47  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  24.74 
 
 
247 aa  46.2  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  24.65 
 
 
243 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  26.15 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  24.31 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  27.83 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  28.68 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1298  hypothetical protein  26.57 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  29.29 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  27.18 
 
 
550 aa  42.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2895  HEAT domain containing protein  32.14 
 
 
367 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  28.8 
 
 
236 aa  42  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>