37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6988 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6988  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 		 233 aa  470  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3013  DNA-7-methylguanine glycosylase  84.05 
 
 		 231 aa  390  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  44.64 
 
 		 217 aa  191  7e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  30.97 
 
 		 237 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  31.42 
 
 		 237 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  32.55 
 
 		 222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  30.09 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  29.52 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  30.09 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  30.09 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  30.09 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  30.09 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1132  hypothetical protein  33.63 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  30.09 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  30.09 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2437  DNA-7-methylguanine glycosylase  38.31 
 
 		 210 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000187196  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  32.89 
 
 		 223 aa  122  7e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  34.23 
 
 		 237 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  33.78 
 
 		 228 aa  108  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  36.84 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  34.96 
 
 		 223 aa  104  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  34.29 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  34.45 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  34.45 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  34.36 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1275  DNA alkylation repair protein  36.43 
 
 		 172 aa  93.6  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0157146  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  29.39 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  30.09 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  29.78 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  28.75 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  25.32 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  28.03 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  23.33 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  26.87 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  19.38 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  22.73 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>