46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4018 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 		 229 aa  455  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  59.36 
 
 		 227 aa  254  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  51.98 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  54.26 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  54.26 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  54.26 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  51.48 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  48.21 
 
 		 237 aa  178  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  47.35 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  33.18 
 
 		 237 aa  141  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  33.18 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  33.18 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  33.18 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  33.18 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  32.74 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  33.63 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  32.29 
 
 		 237 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  32.74 
 
 		 237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  32.29 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  38.64 
 
 		 217 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6988  DNA alkylation repair enzyme  36.84 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3013  DNA-7-methylguanine glycosylase  36.73 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  30.19 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  29.82 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1132  hypothetical protein  28.83 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2437  DNA-7-methylguanine glycosylase  31.12 
 
 		 210 aa  89  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000187196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  30.57 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1275  DNA alkylation repair protein  30.77 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0157146  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  31.14 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  26.67 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  29.46 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  36.45 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  31.68 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  28.32 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  32.17 
 
 		 550 aa  52.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  21.28 
 
 		 236 aa  52  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  25.21 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  29.03 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  25.2 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  25.7 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  24.53 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  21.46 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  25.89 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  31.96 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  32.29 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  36.14 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>