58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6016 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 		 261 aa  512  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  30.74 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  31.48 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  31.74 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  31.74 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  31.74 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  30.97 
 
 		 228 aa  92.4  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  33.77 
 
 		 234 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6988  DNA alkylation repair enzyme  30.09 
 
 		 233 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  24.68 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3013  DNA-7-methylguanine glycosylase  30.13 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  24.24 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  24.24 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  24.68 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  24.78 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  24.78 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  24.78 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  24.68 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  24.68 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  30.52 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  33.49 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  32.88 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  28.33 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  24.24 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1132  hypothetical protein  25.45 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110676  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  24.55 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  28.09 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  26.44 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2437  DNA-7-methylguanine glycosylase  27.98 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000187196  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2339  hypothetical protein  38.66 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0326772  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  23.08 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  27.8 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  26.79 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  27 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  25.22 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  29.87 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  22.28 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  22.49 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  21.54 
 
 		 245 aa  52.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  22.92 
 
 		 263 aa  52.4  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  24.62 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  25.82 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  20.26 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2061  hypothetical protein  30.32 
 
 		 176 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000010628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  26.34 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  22.22 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  25.98 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  23.42 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  23.55 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_520  hypothetical protein  23.29 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  28.57 
 
 		 236 aa  45.4  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  22.27 
 
 		 237 aa  45.8  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  22.89 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  31.58 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4304  hypothetical protein  25 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.648821  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1275  DNA alkylation repair protein  26.53 
 
 		 172 aa  44.3  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0157146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  26.97 
 
 		 236 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  28.93 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>