44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_520 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_520  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  496  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0581  hypothetical protein  85.77 
 
 		 240 aa  422  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0555  DNA alkylation repair enzyme-like protein  82.63 
 
 		 240 aa  408  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1298  hypothetical protein  50.45 
 
 		 235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4304  hypothetical protein  53.99 
 
 		 218 aa  227  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.648821  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2664  hypothetical protein  45 
 
 		 229 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0836  hypothetical protein  47.64 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1596  hypothetical protein  38.43 
 
 		 232 aa  165  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2310  hypothetical protein  38.53 
 
 		 227 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2073  hypothetical protein  37.33 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2734  hypothetical protein  32.52 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000970803  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2978  hypothetical protein  33.13 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000992399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2946  hypothetical protein  31.29 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2986  hypothetical protein  31.9 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000288545  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2940  hypothetical protein  31.29 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6684100000000001e-56 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2732  hypothetical protein  31.29 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2941  hypothetical protein  31.29 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000572479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2683  hypothetical protein  31.29 
 
 		 227 aa  85.1  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000553491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2299  hypothetical protein  31.29 
 
 		 227 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0222691  hitchhiker  5.32762e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2660  hypothetical protein  30.67 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113458  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0294  protein of unknown function DUF1061  27.18 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508637  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  29.23 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  26.56 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3446  hypothetical protein  25.31 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1553  hypothetical protein  23.66 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3386  protein of unknown function DUF1061  22.92 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  26.5 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  23.98 
 
 		 234 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3204  hypothetical protein  23.46 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0529  hypothetical protein  23.04 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0164114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  23.29 
 
 		 261 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0067  hypothetical protein  22.22 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2988  hypothetical protein  22.89 
 
 		 235 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000939837  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3335  hypothetical protein  22.89 
 
 		 229 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.694909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3313  hypothetical protein  22.89 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3091  hypothetical protein  22.89 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104599  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0505  hypothetical protein  40.74 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.459483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  24.62 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1043  hypothetical protein  20.79 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5568  hypothetical protein  22.84 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.982925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2658  protein of unknown function DUF1061  21.21 
 
 		 236 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3305  hypothetical protein  21.69 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3273  hypothetical protein  23.98 
 
 		 235 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179286  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  23.02 
 
 		 243 aa  42  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>