43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0516 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 		 243 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  70.35 
 
 		 234 aa  328  6e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  53.51 
 
 		 232 aa  244  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  51.08 
 
 		 242 aa  234  7e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  52.19 
 
 		 236 aa  232  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  55.65 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  54.74 
 
 		 257 aa  228  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  46.22 
 
 		 238 aa  228  7e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  54.22 
 
 		 236 aa  223  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  47.41 
 
 		 236 aa  211  7e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  45.37 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  49.11 
 
 		 235 aa  207  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  47.14 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  40.43 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  44.02 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  39.73 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  40.19 
 
 		 550 aa  155  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  42.99 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  40.38 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  40.3 
 
 		 238 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  30.29 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  30.42 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  28.02 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  27.97 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  34.08 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  26.11 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  30 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  29.49 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  27.8 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  28.3 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  28.51 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  27.5 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  25 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  27.67 
 
 		 217 aa  52.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  23.5 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  26.85 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  25.88 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  26.95 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  26.95 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  26.95 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  24.65 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1298  hypothetical protein  29.85 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  25.82 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>