47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3708 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  517  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  55.33 
 
 		 251 aa  291  9e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  32.27 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  26.89 
 
 		 240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  29.91 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  27.71 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  30.54 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  28.77 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  28.22 
 
 		 237 aa  101  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  27.12 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  35.66 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  26.82 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  33.09 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  25.46 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  23.89 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  25 
 
 		 550 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  27.17 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  24.17 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  25 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  26.47 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  24.19 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  31.58 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  23.72 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  23.53 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  25.21 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  31.54 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  23.72 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  23.72 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  23.72 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  23.72 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  25.52 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  31.51 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  23.72 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  28.89 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  25.14 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  25 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  23.85 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  26.03 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  25.5 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  23.39 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  23.85 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  22.12 
 
 		 227 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  23.39 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  27.07 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  25.54 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  21.38 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  22.89 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>