45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2880 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 		 237 aa  463  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  44.64 
 
 		 234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  46.19 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  37.07 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  42.92 
 
 		 234 aa  177  9e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  46.32 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  41.3 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  41.4 
 
 		 242 aa  176  4e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  39.83 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  38.2 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  42.98 
 
 		 243 aa  171  6.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  41.2 
 
 		 243 aa  168  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  44.39 
 
 		 247 aa  165  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  43.91 
 
 		 236 aa  165  5e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  42.06 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  40.77 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  43.58 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  40.17 
 
 		 550 aa  151  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  40.64 
 
 		 239 aa  134  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  39.63 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  25.2 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  26.86 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  33.86 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  23.43 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  32.03 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  25.93 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  28.64 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  29.23 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  28.45 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  23.33 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  32.33 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  32.19 
 
 		 234 aa  48.5  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  28.95 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  22.38 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  22.38 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  28.93 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  23.53 
 
 		 237 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  23.53 
 
 		 237 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  22.38 
 
 		 237 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  23.53 
 
 		 237 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  29.29 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  22.38 
 
 		 237 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  23.19 
 
 		 237 aa  42  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  22.38 
 
 		 237 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3013  DNA-7-methylguanine glycosylase  30.08 
 
 		 231 aa  41.6  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>