38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B3013 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B3013  DNA-7-methylguanine glycosylase  100 
 
 		 231 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6988  DNA alkylation repair enzyme  84.05 
 
 		 233 aa  390  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  44.64 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1132  hypothetical protein  35.51 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  31.53 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  32.56 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  31.7 
 
 		 237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  31.08 
 
 		 237 aa  125  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  33.49 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  31.53 
 
 		 237 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  31.25 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2437  DNA-7-methylguanine glycosylase  37.25 
 
 		 210 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000187196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  31.25 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  31.25 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  31.25 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  31.08 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  30.18 
 
 		 237 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  36.67 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  33.93 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  34.53 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  36.15 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  36.32 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  36.32 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1275  DNA alkylation repair protein  37.59 
 
 		 172 aa  97.8  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0157146  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  32.62 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  31.47 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  33.33 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  30.13 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  30.58 
 
 		 233 aa  72  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  29.49 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  33.61 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  25.54 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  30 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  30 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  29.12 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  23.24 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  23 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  30.08 
 
 		 237 aa  42  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>