56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5330 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  99.57 
 
 		 231 aa  467  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  54.26 
 
 		 229 aa  218  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  44.64 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  44.25 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  48.67 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  46.19 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  42.6 
 
 		 237 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  36.28 
 
 		 237 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  35.4 
 
 		 237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  35.4 
 
 		 237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  34.51 
 
 		 237 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  35.84 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  35.84 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  35.84 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  35.84 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  34.96 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  34.96 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  32.43 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  39.81 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  31.72 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2437  DNA-7-methylguanine glycosylase  36.82 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000187196  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1132  hypothetical protein  31.28 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110676  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6988  DNA alkylation repair enzyme  34.78 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3013  DNA-7-methylguanine glycosylase  36.05 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  31.74 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1275  DNA alkylation repair protein  36.99 
 
 		 172 aa  92.4  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0157146  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  24.89 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  30.21 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  23.7 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  28.94 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  26.39 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  29.78 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  21.43 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  27.86 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  19.25 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  27.53 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  25.37 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  27.59 
 
 		 550 aa  52  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  22.38 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  26.29 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  26.81 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  21.2 
 
 		 237 aa  48.5  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  22.6 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  26.09 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  33.33 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  30.11 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  28.48 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  20.18 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  26.27 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1298  hypothetical protein  22.73 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  26.95 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  19.52 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  28.48 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  20.66 
 
 		 224 aa  42  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>