51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0896 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  488  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  68.78 
 
 		 240 aa  353  1e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  66.95 
 
 		 241 aa  337  8e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  63.83 
 
 		 236 aa  324  9e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  58.37 
 
 		 224 aa  262  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  47.64 
 
 		 250 aa  258  7e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  47.44 
 
 		 263 aa  234  8e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  28.22 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  28.99 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  28.91 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  27.78 
 
 		 232 aa  95.1  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  30.17 
 
 		 236 aa  89.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  29.91 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  29.6 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  35.9 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  29.49 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  30.22 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  26.56 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  23.33 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  27.91 
 
 		 550 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  30.47 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  28.45 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  30.77 
 
 		 247 aa  72  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  28.4 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  27.6 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  26.96 
 
 		 242 aa  67  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  23.18 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  31.11 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  22.75 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  33.59 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  23.61 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  22.75 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  22.75 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  22.75 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  22.75 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  22.75 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  22.32 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  22.75 
 
 		 237 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  25.11 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  25.12 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  22.27 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  23.39 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  24.47 
 
 		 227 aa  52  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  28.79 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  25 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  24.76 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  25.13 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0591  hypothetical protein  45.45 
 
 		 45 aa  45.8  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.425982  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  19.44 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  22.46 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  20.4 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>